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Querino Lima Afonso M, da Fonseca NJ, de Oliveira LC, Lobo FP, Bleicher L. Coevolved Positions Represent Key Functional Properties in the Trypsin-Like Serine Proteases Protein Family. J Chem Inf Model 2020; 60:1060-1068. [DOI: 10.1021/acs.jcim.9b00903] [Citation(s) in RCA: 5] [Impact Index Per Article: 1.3] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 01/03/2023]
Affiliation(s)
- Marcelo Querino Lima Afonso
- Departamento de Bioquímica e Imunologia, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Av. Pres. Antônio Carlos, 6627 - Pampulha, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil 31270-901
| | - Neli J. da Fonseca
- Departamento de Bioquímica e Imunologia, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Av. Pres. Antônio Carlos, 6627 - Pampulha, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil 31270-901
| | - Lucas Carrijo de Oliveira
- Departamento de Bioquímica e Imunologia, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Av. Pres. Antônio Carlos, 6627 - Pampulha, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil 31270-901
| | - Francisco Pereira Lobo
- Departamento de Bioquímica e Imunologia, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Av. Pres. Antônio Carlos, 6627 - Pampulha, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil 31270-901
| | - Lucas Bleicher
- Departamento de Bioquímica e Imunologia, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Av. Pres. Antônio Carlos, 6627 - Pampulha, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil 31270-901
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Collapse
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Thrombin allosteric modulation revisited: a molecular dynamics study. J Mol Model 2009; 16:725-35. [DOI: 10.1007/s00894-009-0590-2] [Citation(s) in RCA: 13] [Impact Index Per Article: 0.9] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 06/24/2009] [Accepted: 09/02/2009] [Indexed: 10/20/2022]
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