1
|
Pratiwi L, Mashudi FH, Ningtyas MC, Sutanto H, Romadhon PZ. Genetic Profiling of Acute and Chronic Leukemia via Next-Generation Sequencing: Current Insights and Future Perspectives. Hematol Rep 2025; 17:18. [PMID: 40277842 PMCID: PMC12026831 DOI: 10.3390/hematolrep17020018] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 03/04/2025] [Revised: 03/24/2025] [Accepted: 03/27/2025] [Indexed: 04/26/2025] Open
Abstract
Leukemia is a heterogeneous group of hematologic malignancies characterized by distinct genetic and molecular abnormalities. Advancements in genomic technologies have significantly transformed the diagnosis, prognosis, and treatment strategies for leukemia. Among these, next-generation sequencing (NGS) has emerged as a powerful tool, enabling high-resolution genomic profiling that surpasses conventional diagnostic approaches. By providing comprehensive insights into genetic mutations, clonal evolution, and resistance mechanisms, NGS has revolutionized precision medicine in leukemia management. Despite its transformative potential, the clinical integration of NGS presents challenges, including data interpretation complexities, standardization issues, and cost considerations. However, continuous advancements in sequencing platforms and bioinformatics pipelines are enhancing the reliability and accessibility of NGS in routine clinical practice. The expanding role of NGS in leukemia is paving the way for improved risk stratification, targeted therapies, and real-time disease monitoring, ultimately leading to better patient outcomes. This review highlights the impact of NGS on leukemia research and clinical applications, discussing its advantages over traditional diagnostic techniques, key sequencing approaches, and emerging challenges. As precision oncology continues to evolve, NGS is expected to play an increasingly central role in the diagnosis and management of leukemia, driving innovations in personalized medicine and therapeutic interventions.
Collapse
Affiliation(s)
- Laras Pratiwi
- Internal Medicine Study Program, Department of Internal Medicine, Faculty of Medicine, Universitas Airlangga, Surabaya 60132, Indonesia; (L.P.); (F.H.M.); (M.C.N.)
- Department of Internal Medicine, Dr. Soetomo General Academic Hospital, Surabaya 60286, Indonesia
| | - Fawzia Hanum Mashudi
- Internal Medicine Study Program, Department of Internal Medicine, Faculty of Medicine, Universitas Airlangga, Surabaya 60132, Indonesia; (L.P.); (F.H.M.); (M.C.N.)
- Department of Internal Medicine, Dr. Soetomo General Academic Hospital, Surabaya 60286, Indonesia
| | - Mukti Citra Ningtyas
- Internal Medicine Study Program, Department of Internal Medicine, Faculty of Medicine, Universitas Airlangga, Surabaya 60132, Indonesia; (L.P.); (F.H.M.); (M.C.N.)
- Department of Internal Medicine, Dr. Soetomo General Academic Hospital, Surabaya 60286, Indonesia
| | - Henry Sutanto
- Internal Medicine Study Program, Department of Internal Medicine, Faculty of Medicine, Universitas Airlangga, Surabaya 60132, Indonesia; (L.P.); (F.H.M.); (M.C.N.)
- Department of Internal Medicine, Dr. Soetomo General Academic Hospital, Surabaya 60286, Indonesia
| | - Pradana Zaky Romadhon
- Division of Hematology and Medical Oncology, Department of Internal Medicine, Faculty of Medicine, Universitas Airlangga, Surabaya 60132, Indonesia
- Department of Internal Medicine, Airlangga University Hospital, Surabaya 60115, Indonesia
| |
Collapse
|
2
|
Magyar E, Újfalusi A, Czenke M, Méhes G. [Somatic JAK2 gene mutation is an evolving risk factor in cardiovascular diseases]. Orv Hetil 2024; 165:883-890. [PMID: 38852144 DOI: 10.1556/650.2024.33055] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 03/14/2024] [Accepted: 04/24/2024] [Indexed: 06/11/2024]
Abstract
A JAK-kináz működése egyes, sejtfelszíni receptorokhoz kötött jelátviteli
útvonalak központi eleme (JAK/STAT útvonal), a fiziológiás sejtaktiváció
közvetítője. Közvetítő hatása a myeloid eredetű sejtekben, elsősorban
macrophagokban, neutrophil granulocytákban, illetve a thrombocytákban is
szükséges a nem specifikus gyulladásos reakció elindításához. A jelátviteli
útvonal kóros aktivációja a krónikus myeloproliferativ neoplasiákban az egyik
leggyakoribb genetikai eltérés és a fokozott myelo- és thrombopoesis egyik jól
ismert ’driver’ mechanizmusa. A myeloproliferativ neoplasiák diagnosztikájához a
szerzett patogén JAK2-mutációk (elsősorban a
V617F variáns) kimutatása is hozzátartozik. Ismertté vált
ugyanakkor, hogy a génhiba – más, ritkább eltérések mellett – akár hosszú ideig
fennállhat jelentős hematológiai eltérések nélkül. Ezt az állapotot klonális
haemopoesisnek nevezik. A variáns JAK2 újabb megfigyelések
szerint a myeloid eredetű sejtek funkciójára ebben a helyzetben is komoly
aktiváló hatást fejthet ki, és meggyőző összefüggéseket mutattak ki a
gyulladásos háttérrel rendelkező cardiovascularis szövődményekkel kapcsolatosan.
A klonális JAK2-eltérés, valamint az ischaemiás szívbetegség,
illetve a hasi aortaaneurysma kialakulása között is jelentős összefüggések
mérhetők. Mára egyértelmű, hogy az atheromaképződés és a következményes
coronariasclerosis kialakulása egy komplex thromboinflammatoricus folyamat
következménye, és jelentős mértékben függ többek között a JAK2
mediálta szöveti macrophag–granulocyta interakcióktól. Közleményünkben a
fokozott kockázat hátterében húzódó mechanizmusokat és a rendelkezésre álló
legújabb ismereteket elemezzük. Orv Hetil. 2024; 165(23): 883–890.
Collapse
Affiliation(s)
- Eszter Magyar
- 1 Debreceni Egyetem, Általános Orvostudományi Kar, Patológiai Intézet Debrecen, Nagyerdei krt. 98., 4032 Magyarország
| | - Anikó Újfalusi
- 2 Debreceni Egyetem, Általános Orvostudományi Kar, Laboratóriumi Medicina Intézet Budapest Magyarország
| | - Marianna Czenke
- 1 Debreceni Egyetem, Általános Orvostudományi Kar, Patológiai Intézet Debrecen, Nagyerdei krt. 98., 4032 Magyarország
| | - Gábor Méhes
- 1 Debreceni Egyetem, Általános Orvostudományi Kar, Patológiai Intézet Debrecen, Nagyerdei krt. 98., 4032 Magyarország
| |
Collapse
|
3
|
Vukotić M, Kapor S, Simon F, Cokic V, Santibanez JF. Mesenchymal stromal cells in myeloid malignancies: Immunotherapeutic opportunities. Heliyon 2024; 10:e25081. [PMID: 38314300 PMCID: PMC10837636 DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e25081] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 10/05/2023] [Revised: 01/18/2024] [Accepted: 01/19/2024] [Indexed: 02/06/2024] Open
Abstract
Myeloid malignancies are clonal disorders of the progenitor cells or hematopoietic stem cells, including acute myeloid leukemia, myelodysplastic syndromes, myeloproliferative malignancies, and chronic myelomonocytic leukemia. Myeloid neoplastic cells affect the proliferation and differentiation of other hematopoietic lineages in the bone marrow and peripheral blood, leading to severe and life-threatening complications. Mesenchymal stromal cells (MSCs) residing in the bone marrow exert immunosuppressive functions by suppressing innate and adaptive immune systems, thus creating a supportive and tolerant microenvironment for myeloid malignancy progression. This review summarizes the significant features of MSCs in myeloid malignancies, including their role in regulating cell growth, cell death, and antineoplastic resistance, in addition to their immunosuppressive contributions. Understanding the implications of MSCs in myeloid malignancies could pave the path for potential use in immunotherapy.
Collapse
Affiliation(s)
- Milica Vukotić
- Molecular Oncology Group, Institute for Medical Research, University of Belgrade, Belgrade, Serbia
| | - Suncica Kapor
- Department of Hematology, Clinical Hospital Center “Dr. Dragisa Misovic-Dedinje,” University of Belgrade, Serbia
| | - Felipe Simon
- Laboratory of Integrative Physiopathology, Faculty of Life Sciences, Universidad Andres Bello, Santiago, Chile
- Millennium Institute on Immunology and Immunotherapy, Santiago, Chile
- Millennium Nucleus of Ion Channel-Associated Diseases, Universidad de Chile, Santiago, Chile
| | - Vladan Cokic
- Molecular Oncology Group, Institute for Medical Research, University of Belgrade, Belgrade, Serbia
| | - Juan F. Santibanez
- Molecular Oncology Group, Institute for Medical Research, University of Belgrade, Belgrade, Serbia
- Centro Integrativo de Biología y Química Aplicada (CIBQA), Universidad Bernardo O'Higgins, Santiago, Chile
| |
Collapse
|