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Sodré CFL, Macedo W, Feitosa LM, Sousa NSM, Carvalho-Neta RNF, Carvalho Costa LF, Nunes JLS, Tchaicka L. Molecular identification of sharks from the genus Sphyrna (Elasmobranchii: Chondrichthyes) in Maranhão Coast (Brazil). BRAZ J BIOL 2024; 84:e274862. [PMID: 38511772 DOI: 10.1590/1519-6984.274862] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [MESH Headings] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 05/16/2023] [Accepted: 01/18/2024] [Indexed: 03/22/2024] Open
Abstract
Sharks of the genus Sphyrna are under intense exploitation globally. In Brazil's northern coast, this genus represents a high proportion of fisheries landings and comprises four species. However, due to difficulty of specific identification when specimens are landed, most of the records are limited to the genus level. Here we analyzed the effectiveness of ITS2 (Internal Transcribed Spacer 2 of rDNA) fragment length protocol (Abercrombie et al., 2005) for identifying hammerhead shark species, comparing with the analysis of COI (Cytochrome oxidase subunit I) and ITS2 sequences. We evaluated samples of muscle tissue acquired in the main fishing ports of Maranhão: Carutapera, Raposa e Tutóia. Sampling was conducted between March 2017 to March 2018 and complemented with material deposited in collection (2015). COI results indicated the occurrence of endangered species which are prohibited to be landed. These include Sphyrna mokarran (67%), S. lewini (15%), S. tudes (3%), and S. tiburo (15%). For the ITS2 marker, we investigated the optimization of the protocol developed by Abercrombie (2005) for to improve the use in this geographical area througout design of a new primers.
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Affiliation(s)
- C F L Sodré
- Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pós-graduação em Ecologia e Conservação da Biodiversidade, São Luís, MA, Brasil
| | - W Macedo
- Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pós-graduação em Recursos Aquáticos e Pesca, São Luís, MA, Brasil
| | - L M Feitosa
- Universidade Federal de Pernambuco - UFPE, Departamento de Pesca e Aquicultura, Laboratório de Dinâmica de Populações Marinhas - DIMAR, Recife, PE, Brasil
| | - N S M Sousa
- Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pós-graduação em Ecologia e Conservação da Biodiversidade, São Luís, MA, Brasil
| | - R N F Carvalho-Neta
- Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pós-graduação em Ecologia e Conservação da Biodiversidade, São Luís, MA, Brasil
- Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pos-graduação em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia/BIONORTE, São Luís, MA, Brasil
| | - L F Carvalho Costa
- Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pós-graduação em Ecologia e Conservação da Biodiversidade, São Luís, MA, Brasil
| | - J L S Nunes
- Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pos-graduação em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia/BIONORTE, São Luís, MA, Brasil
| | - L Tchaicka
- Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pós-graduação em Ecologia e Conservação da Biodiversidade, São Luís, MA, Brasil
- Universidade Estadual do Maranhão - UEMA, Programa de Pos-graduação em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia/BIONORTE, São Luís, MA, Brasil
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