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Juge PA, Borie R, Kannengiesser C, Gazal S, Revy P, Wemeau-Stervinou L, Debray MP, Ottaviani S, Marchand-Adam S, Nathan N, Thabut G, Richez C, Nunes H, Callebaut I, Justet A, Leulliot N, Bonnefond A, Salgado D, Richette P, Desvignes JP, Lioté H, Froguel P, Allanore Y, Sand O, Dromer C, Flipo RM, Clément A, Béroud C, Sibilia J, Coustet B, Cottin V, Boissier MC, Wallaert B, Schaeverbeke T, Dastot le Moal F, Frazier A, Ménard C, Soubrier M, Saidenberg N, Valeyre D, Amselem S, Boileau C, Crestani B, Dieudé P. Shared genetic predisposition in rheumatoid arthritis-interstitial lung disease and familial pulmonary fibrosis. Eur Respir J 2017; 49:49/5/1602314. [PMID: 28495692 DOI: 10.1183/13993003.02314-2016] [Citation(s) in RCA: 136] [Impact Index Per Article: 17.0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 11/28/2016] [Accepted: 02/11/2017] [Indexed: 11/05/2022]
Abstract
Despite its high prevalence and mortality, little is known about the pathogenesis of rheumatoid arthritis-associated interstitial lung disease (RA-ILD). Given that familial pulmonary fibrosis (FPF) and RA-ILD frequently share the usual pattern of interstitial pneumonia and common environmental risk factors, we hypothesised that the two diseases might share additional risk factors, including FPF-linked genes. Our aim was to identify coding mutations of FPF-risk genes associated with RA-ILD.We used whole exome sequencing (WES), followed by restricted analysis of a discrete number of FPF-linked genes and performed a burden test to assess the excess number of mutations in RA-ILD patients compared to controls.Among the 101 RA-ILD patients included, 12 (11.9%) had 13 WES-identified heterozygous mutations in the TERT, RTEL1, PARN or SFTPC coding regions. The burden test, based on 81 RA-ILD patients and 1010 controls of European ancestry, revealed an excess of TERT, RTEL1, PARN or SFTPC mutations in RA-ILD patients (OR 3.17, 95% CI 1.53-6.12; p=9.45×10-4). Telomeres were shorter in RA-ILD patients with a TERT, RTEL1 or PARN mutation than in controls (p=2.87×10-2).Our results support the contribution of FPF-linked genes to RA-ILD susceptibility.
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Affiliation(s)
- Pierre-Antoine Juge
- APHP, Hôpital Bichat, Service de Rhumatologie, DHU FIRE, Paris, France.,Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,These authors contributed equally
| | - Raphaël Borie
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,APHP, Hôpital Bichat, Service de Pneumologie A, DHU FIRE, Paris, France.,INSERM U1152, Paris, France.,These authors contributed equally
| | - Caroline Kannengiesser
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,APHP, Service de Génétique, Hôpital Bichat, Paris, France.,INSERM, UMR_1149 Centre de Recherches sur l'Inflammation Paris, Paris, France.,These authors contributed equally
| | - Steven Gazal
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,INSERM, IAME, UMR_1137, Paris, France.,APHP, Plateforme de génomique constitutionnelle du GHU Nord, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Patrick Revy
- INSERM UMR_1163, Laboratory of Genome Dynamics in the Immune System, Institut Imagine, Paris, France.,Université Paris Descartes, Sorbonne Cité, Paris, France
| | - Lidwine Wemeau-Stervinou
- CHRU de Lille, Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie, Centre de compétence maladies pulmonaires rares, FHU IMMINENT, Lille, France.,Université Lille 2, Lille, France
| | - Marie-Pierre Debray
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,APHP, Hôpital Bichat, Service de Radiologie, Paris, France
| | - Sébastien Ottaviani
- APHP, Hôpital Bichat, Service de Rhumatologie, DHU FIRE, Paris, France.,Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Sylvain Marchand-Adam
- CHRU Tours, Service de Pneumologie, Tours, France.,Université Francois Rabelais, Tours, France.,INSERM, U1100, Tours, France
| | - Nadia Nathan
- APHP, Service de Pneumologie Pédiatrique et Centre de référence des maladies respiratoires rares, Hôpital Trousseau, Paris, France.,INSERM UMR_S933, Paris, France.,Université Pierre et Marie Curie, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Gabriel Thabut
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,INSERM U1152, Paris, France.,APHP, Hôpital Bichat, Service de Pneumologie B, DHU FIRE, Paris, France
| | - Christophe Richez
- CHU de Bordeaux, service de rhumatologie, Bordeaux, France.,Immuno ConcEpT, CNRS UMR_5164, Bordeaux, France.,Université de Bordeaux, Bordeaux, France
| | - Hilario Nunes
- AP-HP, Hôpital Avicenne, Service de Pneumologie, Bobigny, France.,Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Isabelle Callebaut
- Université Pierre et Marie Curie, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,CNRS UMR_7590, MNHM-IRD-IUC, Paris, France
| | - Aurélien Justet
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,APHP, Hôpital Bichat, Service de Pneumologie A, DHU FIRE, Paris, France
| | - Nicolas Leulliot
- Université Paris Descartes, Sorbonne Cité, Paris, France.,Laboratoire de Cristallographie et RMN Biologiques, UMR CNRS 8015, Faculté de Pharmacie, Paris, France
| | - Amélie Bonnefond
- Université Lille 2, Lille, France.,CNRS, UMR_8199, Lille, France.,European Genomic Institute for Diabetes, Lille, France
| | - David Salgado
- Aix-Marseille Université, GMGF, Marseille, France.,INSERM, UMR_S 910, Marseille, France
| | - Pascal Richette
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,AP-HP, hôpital Lariboisière, Service de Rhumatologie, Paris, France.,INSERM, UMR_1132, Paris, France
| | - Jean-Pierre Desvignes
- Aix-Marseille Université, GMGF, Marseille, France.,INSERM, UMR_S 910, Marseille, France
| | - Huguette Lioté
- APHP, Hôpital Tenon, Service de Pneumologie, Paris, France
| | - Philippe Froguel
- Université Lille 2, Lille, France.,CNRS, UMR_8199, Lille, France.,Dept of Genomics of Common Diseases, School of Public Health, Imperial College London, Hammersmith Hospital, London, UK
| | - Yannick Allanore
- Université Paris Descartes, Sorbonne Cité, Paris, France.,APHP, Hôpital Cochin, Service de Rhumatologie A, Paris, France.,INSERM, U1016, UMR_8104, Paris, France
| | - Olivier Sand
- Université Lille 2, Lille, France.,CNRS, UMR_8199, Lille, France.,European Genomic Institute for Diabetes, Lille, France
| | - Claire Dromer
- Université de Bordeaux, Bordeaux, France.,CHU de Bordeaux, Service d'Imagerie Thoracique et Cardiovasculaire, Pessac, France
| | - René-Marc Flipo
- Université Lille 2, Lille, France.,CHU de Lille, Service de Rhumatologie, Lille, France
| | - Annick Clément
- APHP, Service de Pneumologie Pédiatrique et Centre de référence des maladies respiratoires rares, Hôpital Trousseau, Paris, France.,INSERM UMR_S933, Paris, France.,Université Pierre et Marie Curie, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Christophe Béroud
- Aix-Marseille Université, GMGF, Marseille, France.,INSERM, UMR_S 910, Marseille, France.,APHM, Hôpital La Timone Enfants, Laboratoire de Génétique Moléculaire, Marseille, France
| | - Jean Sibilia
- CHRU de Strasbourg, Service de Rhumatologie, Hôpital de Hautepierre, Strasbourg, France.,INSERM UMR_S1109, Laboratoire d'Immuno-Rhumatologie Moléculaire, CRHI, FMTS, Université de Strasbourg, Strasbourg, France.,Fédération Hospitalo-Universitaire OMICARE, Strasbourg, France
| | - Baptiste Coustet
- APHP, Hôpital Bichat, Service de Rhumatologie, DHU FIRE, Paris, France.,Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Vincent Cottin
- Hospices Civils de Lyon, Hôpital Louis Pradel, Centre national de référence des maladies pulmonaires rares, Lyon, France.,INRA, UMR_754, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France
| | - Marie-Christophe Boissier
- Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,INSERM U1125, Bobigny, France.,APHP, GH HUPSSD, Service de Rhumatologie, Bobigny, France
| | - Benoit Wallaert
- CHRU de Lille, Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie, Centre de compétence maladies pulmonaires rares, FHU IMMINENT, Lille, France.,Université Lille 2, Lille, France
| | - Thierry Schaeverbeke
- CHU de Bordeaux, service de rhumatologie, Bordeaux, France.,Immuno ConcEpT, CNRS UMR_5164, Bordeaux, France.,Université de Bordeaux, Bordeaux, France
| | - Florence Dastot le Moal
- APHP, Service de Pneumologie Pédiatrique et Centre de référence des maladies respiratoires rares, Hôpital Trousseau, Paris, France.,Université Pierre et Marie Curie, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,APHP, Département de Génétique, Hôpital Trousseau, Paris, France
| | - Aline Frazier
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,AP-HP, hôpital Lariboisière, Service de Rhumatologie, Paris, France
| | - Christelle Ménard
- APHP, Service de Pneumologie Pédiatrique et Centre de référence des maladies respiratoires rares, Hôpital Trousseau, Paris, France.,INSERM UMR_S933, Paris, France.,Université Pierre et Marie Curie, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Martin Soubrier
- CHU Clermont-Ferrand, Service de Rhumatologie, INRA, UMR1019, UNH, CRNH Auvergne, Clermont-Ferrand, France
| | - Nathalie Saidenberg
- Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,APHP, GH HUPSSD, Service de Rhumatologie, Bobigny, France
| | - Dominique Valeyre
- AP-HP, Hôpital Avicenne, Service de Pneumologie, Bobigny, France.,Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Serge Amselem
- APHP, Service de Pneumologie Pédiatrique et Centre de référence des maladies respiratoires rares, Hôpital Trousseau, Paris, France.,INSERM UMR_S933, Paris, France.,APHP, Département de Génétique, Hôpital Trousseau, Paris, France
| | | | - Catherine Boileau
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,APHP, Service de Génétique, Hôpital Bichat, Paris, France.,INSERM, UMR_1148, Maladies structurelles cardiovasculaires, Paris, France
| | - Bruno Crestani
- Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,APHP, Hôpital Bichat, Service de Pneumologie A, DHU FIRE, Paris, France.,INSERM U1152, Paris, France
| | - Philippe Dieudé
- APHP, Hôpital Bichat, Service de Rhumatologie, DHU FIRE, Paris, France .,Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,INSERM, UMR_1149 Centre de Recherches sur l'Inflammation Paris, Paris, France
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Philippot Q, Cazes A, Borie R, Debray MP, Danel C, Hurtado Nedelec M, Boudjemaa S, Sroussi D, Dupin C, Mal H, Dauriat G, Jean-Baptiste S, Jebrak G, Castier Y, Mordant P, Thabut G, Brugière O. Secondary pulmonary alveolar proteinosis after lung transplantation: a single-centre series. Eur Respir J 2017; 49:49/2/1601369. [PMID: 28232408 DOI: 10.1183/13993003.01369-2016] [Citation(s) in RCA: 9] [Impact Index Per Article: 1.1] [Reference Citation Analysis] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 07/10/2016] [Accepted: 12/15/2016] [Indexed: 11/05/2022]
Affiliation(s)
- Quentin Philippot
- Service de Pneumologie B et Transplantation, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Aurélie Cazes
- Service d'Anatomie Pathologique, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France.,INSERM U1152, Paris, France.,University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,Département hospitalo-universitaire FIRE, Paris, France
| | - Raphaël Borie
- INSERM U1152, Paris, France.,University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,Département hospitalo-universitaire FIRE, Paris, France.,Service de Pneumologie A (Competence Center for Rare Pulmonary Diseases), Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Marie-Pierre Debray
- Service de Radiologie, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Claire Danel
- Service d'Anatomie Pathologique, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France.,INSERM U1152, Paris, France.,University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,Département hospitalo-universitaire FIRE, Paris, France
| | - Maria Hurtado Nedelec
- University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,UF Dysfonctionnements Immunitaires, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Sabah Boudjemaa
- Département d'Anatomie Pathologique, Hôpital Trousseau, Paris, France
| | - Déborah Sroussi
- Service de Pneumologie B et Transplantation, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France.,University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Clairelyne Dupin
- Service de Pneumologie B et Transplantation, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France.,University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Hervé Mal
- Service de Pneumologie B et Transplantation, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France.,INSERM U1152, Paris, France.,University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,Département hospitalo-universitaire FIRE, Paris, France
| | - Gaëlle Dauriat
- Service de Pneumologie B et Transplantation, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Sylvain Jean-Baptiste
- Service de Réanimation Chirurgicale, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Gilles Jebrak
- Service de Pneumologie B et Transplantation, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Yves Castier
- University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,Département hospitalo-universitaire FIRE, Paris, France.,Service de chirurgie Vasculaire et Thoracique, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Pierre Mordant
- University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,Département hospitalo-universitaire FIRE, Paris, France.,Service de chirurgie Vasculaire et Thoracique, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Gabriel Thabut
- Service de Pneumologie B et Transplantation, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France.,INSERM U1152, Paris, France.,University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,Département hospitalo-universitaire FIRE, Paris, France
| | - Olivier Brugière
- Service de Pneumologie B et Transplantation, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Hôpital Bichat, Paris, France .,INSERM U1152, Paris, France.,University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,Département hospitalo-universitaire FIRE, Paris, France
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Borie R, Tabèze L, Thabut G, Nunes H, Cottin V, Marchand-Adam S, Prevot G, Tazi A, Cadranel J, Mal H, Wemeau-Stervinou L, Bergeron Lafaurie A, Israel-Biet D, Picard C, Reynaud Gaubert M, Jouneau S, Naccache JM, Mankikian J, Ménard C, Cordier JF, Valeyre D, Reocreux M, Grandchamp B, Revy P, Kannengiesser C, Crestani B. Prevalence and characteristics of TERT and TERC mutations in suspected genetic pulmonary fibrosis. Eur Respir J 2016; 48:1721-1731. [PMID: 27836952 DOI: 10.1183/13993003.02115-2015] [Citation(s) in RCA: 117] [Impact Index Per Article: 13.0] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 12/14/2015] [Accepted: 09/03/2016] [Indexed: 02/02/2023]
Abstract
Telomerase reverse transcriptase (TERT) or telomerase RNA (TERC) gene mutation is a major monogenic cause of pulmonary fibrosis. Sequencing of TERT/TERC genes is proposed to patients with familial pulmonary fibrosis. Little is known about the possible predictors of this mutation and its impact on prognosis.We retrospectively analysed all the genetic diagnoses made between 2007-2014 in patients with pulmonary fibrosis. We evaluated the prevalence of TERT/TERC disease-associated variant (DAV), factors associated with a DAV, and the impact of the DAV on survival.237 patients with pulmonary fibrosis (153 with familial pulmonary fibrosis, 84 with telomere syndrome features without familial pulmonary fibrosis) were tested for TERT/TERC DAV. DAV was diagnosed in 40 patients (16.8%), including five with non-idiopathic interstitial pneumonia. Prevalence of TERT/TERC DAV did not significantly differ between patients with familial pulmonary fibrosis or with only telomere syndrome features (18.2% versus 16.4%). Young age, red blood cell macrocytosis, and low platelet count were associated with the presence of DAV; the probability of DAV was increased for patients 40-60 years. Transplant-free survival was lower with than without TERT/TERC DAV (4.2 versus 7.2 years; p=0.046).TERT/TERC DAV were associated with specific clinical and biological features and reduced transplant-free survival.
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Affiliation(s)
- Raphael Borie
- APHP, Hôpital Bichat, Service de Pneumologie A, DHU FIRE, Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, Paris, France.,INSERM, Unité 1152; Université Paris Diderot, Paris, France
| | - Laure Tabèze
- APHP, Hôpital Bichat, Service de Pneumologie A, DHU FIRE, Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, Paris, France.,INSERM, Unité 1152; Université Paris Diderot, Paris, France
| | - Gabriel Thabut
- INSERM, Unité 1152; Université Paris Diderot, Paris, France.,Service de Pneumologie B, APHP, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Hilario Nunes
- APHP, Service de Pneumologie, Hôpital Avicenne, Bobigny, France
| | - Vincent Cottin
- Service de Pneumologie, Centre national de référence des maladies pulmonaires rares, Hôpital Louis Pradel, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France
| | | | | | - Abdellatif Tazi
- APHP, Hôpital Saint-Louis, Service de Pneumologie, Paris, France
| | - Jacques Cadranel
- APHP, Service de Pneumologie, Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, Hôpital Tenon, Paris, France
| | - Herve Mal
- Service de Pneumologie B, APHP, Hôpital Bichat, Paris, France
| | - Lidwine Wemeau-Stervinou
- Service de Pneumologie, Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, CHRU de Lille, Lille, France
| | | | | | | | | | - Stephane Jouneau
- Service de Pneumologie, Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, Hôpital Pontchaillou; IRSET UMR 1085, université de Rennes 1, Rennes, France
| | - Jean-Marc Naccache
- APHP, Service de Pneumologie, Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, Hôpital Tenon, Paris, France
| | | | - Christelle Ménard
- Departement de Génétique, APHP, Hôpital Bichat, Paris, France; Université Paris Diderot, Paris, France
| | - Jean-François Cordier
- Service de Pneumologie, Centre national de référence des maladies pulmonaires rares, Hôpital Louis Pradel, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France
| | | | - Marion Reocreux
- Departement de Génétique, APHP, Hôpital Bichat, Paris, France; Université Paris Diderot, Paris, France
| | - Bernard Grandchamp
- Departement de Génétique, APHP, Hôpital Bichat, Paris, France; Université Paris Diderot, Paris, France
| | - Patrick Revy
- INSERM UMR 1163, Laboratory of Genome Dynamics in the Immune System, Paris Descartes-Sorbonne Paris Cité University, Imagine Institute, Paris, France
| | - Caroline Kannengiesser
- Departement de Génétique, APHP, Hôpital Bichat, Paris, France; Université Paris Diderot, Paris, France.,Both authors contributed equally to this work
| | - Bruno Crestani
- APHP, Hôpital Bichat, Service de Pneumologie A, DHU FIRE, Centre de compétence des maladies pulmonaires rares, Paris, France .,INSERM, Unité 1152; Université Paris Diderot, Paris, France.,Both authors contributed equally to this work
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