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Machado E, Vasconcellos SEG, Cerdeira C, Gomes LL, Junqueira R, Carvalho LDD, Ramos JP, Redner P, Campos CED, Caldas PCDS, Gomes APCS, Goldenberg T, Montes FF, Mello FCDQ, Mussi VDO, Lasunskaia E, Soolingen DV, Miranda ABD, Rigouts L, Jong BCD, Meehan CJ, Catanho M, Suffys PN. Whole genome sequence of Mycobacterium kansasii isolates of the genotype 1 from Brazilian patients with pulmonary disease demonstrates considerable heterogeneity. Mem Inst Oswaldo Cruz 2018; 113:e180085. [PMID: 29947722 PMCID: PMC6012682 DOI: 10.1590/0074-02760180085] [Citation(s) in RCA: 3] [Impact Index Per Article: 0.5] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Track Full Text] [Download PDF] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 02/15/2018] [Accepted: 06/05/2018] [Indexed: 11/02/2022] Open
Abstract
Mycobacterium kansasii is an opportunistic pathogen and one of the most commonly encountered species in individuals with lung disease. We here report the complete genome sequence of 12 clinical isolates of M. kansasii from patients with pulmonary disease in Brazil.
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Affiliation(s)
- Edson Machado
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Sidra Ezidio Gonçalves Vasconcellos
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Camillo Cerdeira
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.,Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Lia Lima Gomes
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Ricardo Junqueira
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Luciana Distasio de Carvalho
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Escola Nacional de Saúde Pública, Centro de Referência Professor Hélio Fraga, Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Jesus Pais Ramos
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Escola Nacional de Saúde Pública, Centro de Referência Professor Hélio Fraga, Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Paulo Redner
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Escola Nacional de Saúde Pública, Centro de Referência Professor Hélio Fraga, Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Carlos Eduardo Dias Campos
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Escola Nacional de Saúde Pública, Centro de Referência Professor Hélio Fraga, Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Paulo Cesar de Souza Caldas
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Escola Nacional de Saúde Pública, Centro de Referência Professor Hélio Fraga, Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Ana Paula Chaves Sobral Gomes
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Escola Nacional de Saúde Pública, Centro de Referência Professor Hélio Fraga, Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Telma Goldenberg
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Escola Nacional de Saúde Pública, Centro de Referência Professor Hélio Fraga, Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Fatima Fandinho Montes
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Escola Nacional de Saúde Pública, Centro de Referência Professor Hélio Fraga, Laboratório de Referência Nacional para Tuberculose, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | | | - Vinicius de Oliveira Mussi
- Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, Laboratório de Biologia do Reconhecer, Campos dos Goytacazes, RJ, Brasil
| | - Elena Lasunskaia
- Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, Laboratório de Biologia do Reconhecer, Campos dos Goytacazes, RJ, Brasil
| | - Dick van Soolingen
- National Institute for Public Health and the Environment, Bilthoven, the Netherlands
| | - Antonio Basílio de Miranda
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Leen Rigouts
- Institute of Tropical Medicine, Unit of Mycobacteriology, Antwerp, Belgium
| | - Bouke C de Jong
- Institute of Tropical Medicine, Unit of Mycobacteriology, Antwerp, Belgium
| | - Conor J Meehan
- Institute of Tropical Medicine, Unit of Mycobacteriology, Antwerp, Belgium
| | - Marcos Catanho
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática, Rio de Janeiro, RJ, Brasil
| | - Philip N Suffys
- Fundação Oswaldo Cruz-Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.,Institute of Tropical Medicine, Unit of Mycobacteriology, Antwerp, Belgium
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