|
1
|
Dorella FA, Gala-Garcia A, Pinto AC, Sarrouh B, Antunes CA, Ribeiro D, Aburjaile FF, Fiaux KK, Guimarães LC, Seyffert N, El-Aouar RA, Silva R, Hassan SS, Castro TLP, Marques WS, Ramos R, Carneiro A, de Sá P, Miyoshi A, Azevedo V, Silva A. Progression of 'OMICS' methodologies for understanding the pathogenicity of Corynebacterium pseudotuberculosis: the Brazilian experience. Comput Struct Biotechnol J 2013; 6:e201303013. [PMID: 24688721 PMCID: PMC3962224 DOI: 10.5936/csbj.201303013] [Citation(s) in RCA: 12] [Impact Index Per Article: 1.1] [Reference Citation Analysis] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Download PDF] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 07/01/2013] [Revised: 09/06/2013] [Accepted: 09/08/2013] [Indexed: 11/22/2022] Open
Abstract
Since the first successful attempt at sequencing the Corynebacterium pseudotuberculosis genome, large amounts of genomic, transcriptomic and proteomic data have been generated. C. pseudotuberculosis is an interesting bacterium due to its great zoonotic potential and because it causes considerable economic losses worldwide. Furthermore, different strains of C. pseudotuberculosis are capable of causing various diseases in different hosts. Currently, we seek information about the phylogenetic relationships between different strains of C. pseudotuberculosis isolates from different hosts across the world and to employ these data to develop tools to diagnose and eradicate the diseases these strains cause. In this review, we present the latest findings on C. pseudotuberculosis that have been obtained with the most advanced techniques for sequencing and genomic organization. We also discuss the development of in silico tools for processing these data to prompt a better understanding of this pathogen.
Collapse
Affiliation(s)
- Fernanda A Dorella
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Alfonso Gala-Garcia
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Anne C Pinto
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Boutros Sarrouh
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Camila A Antunes
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Dayana Ribeiro
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Flavia F Aburjaile
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Karina K Fiaux
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Luis C Guimarães
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Núbia Seyffert
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Rachid A El-Aouar
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Renata Silva
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Syed S Hassan
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Thiago L P Castro
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Wanderson S Marques
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Rommel Ramos
- Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém-PA, Brazil
| | - Adriana Carneiro
- Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém-PA, Brazil
| | - Pablo de Sá
- Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém-PA, Brazil
| | - Anderson Miyoshi
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Vasco Azevedo
- Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
| | - Artur Silva
- Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém-PA, Brazil
| |
Collapse
|