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González-Domínguez CA, Fiesco-Roa MO, Gómez-Carmona S, Kleinert-Altamirano API, He M, Daniel EJP, Raymond KM, Abreu-González M, Manrique-Hernández S, González-Jaimes A, Salinas-Marín R, Molina-Garay C, Carrillo-Sánchez K, Flores-Lagunes LL, Jiménez-Olivares M, Muñoz-Rivas A, Cruz-Muñoz ME, Ruíz-García M, Freeze HH, Mora-Montes HM, Alaez-Verson C, Martínez-Duncker I. Corrigendum: ALG1-CDG Caused by Non-Functional Alternative Splicing Involving a Novel Pathogenic Complex Allele. Front Genet 2021; 12:777731. [PMID: 34659374 PMCID: PMC8515999 DOI: 10.3389/fgene.2021.777731] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Download PDF] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 09/15/2021] [Accepted: 09/16/2021] [Indexed: 11/13/2022] Open
Abstract
[This corrects the article DOI: 10.3389/fgene.2021.744884.].
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Affiliation(s)
- Carlos Alberto González-Domínguez
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico.,Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico
| | - Moisés O Fiesco-Roa
- Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Médicas, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Ciudad Universitaria, Mexico City, Mexico.,Laboratorio de Citogenética, Instituto Nacional de Pediatría, Mexico City, Mexico
| | | | - Anke Paula Ingrid Kleinert-Altamirano
- Centro de Rehabilitación e Inclusión Infantil Teletón, Tuxtla Gutiérrez, Mexico.,Hospital Regional de Alta Especialidad Ciudad Salud, Tapachula, Mexico
| | - Miao He
- Palmieri Metabolic Disease Laboratory, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, United States
| | - Earnest James Paul Daniel
- Palmieri Metabolic Disease Laboratory, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, United States
| | - Kimiyo M Raymond
- Department of Laboratory Medicine and Pathology, Laboratory Genetics and Genomics, Mayo Clinic, Rochester, MN, United States
| | | | - Sandra Manrique-Hernández
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico.,Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico
| | - Ana González-Jaimes
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico
| | - Roberta Salinas-Marín
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico
| | - Carolina Molina-Garay
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Karol Carrillo-Sánchez
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Luis Leonardo Flores-Lagunes
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Marco Jiménez-Olivares
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Anallely Muñoz-Rivas
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Mario E Cruz-Muñoz
- Laboratorio de Inmunología Molecular, Facultad de Medicina, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico
| | - Matilde Ruíz-García
- Departamento de Neurología, Instituto Nacional de Pediatría, Mexico City, Mexico
| | - Hudson H Freeze
- Human Genetics Program, Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute, La Jolla, CA, United States
| | - Héctor M Mora-Montes
- Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Guanajuato, Mexico
| | - Carmen Alaez-Verson
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Iván Martínez-Duncker
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico.,Sociedad Latinoamericana de Glicobiología A.C, Cuernavaca, Mexico
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González-Domínguez CA, Fiesco-Roa MO, Gómez-Carmona S, Kleinert-Altamirano API, He M, Daniel EJP, Raymond KM, Abreu-González M, Manrique-Hernández S, González-Jaimes A, Salinas-Marín R, Molina-Garay C, Carrillo-Sánchez K, Flores-Lagunes LL, Jiménez-Olivares M, Muñoz-Rivas A, Cruz-Muñoz ME, Ruíz-García M, Freeze HH, Mora-Montes HM, Alaez-Verson C, Martínez-Duncker I. ALG1-CDG Caused by Non-functional Alternative Splicing Involving a Novel Pathogenic Complex Allele. Front Genet 2021; 12:744884. [PMID: 34567092 PMCID: PMC8458739 DOI: 10.3389/fgene.2021.744884] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Download PDF] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 07/21/2021] [Accepted: 08/05/2021] [Indexed: 11/13/2022] Open
Abstract
This study reports on a Mexican mestizo patient with a multi-systemic syndrome including neurological involvement and a type I serum transferrin profile. Clinical exome sequencing revealed complex alleles in ALG1, the encoding gene for the chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase that participates in the formation of the dolichol-pyrophosphate-GlcNAc2Man5, a lipid-linked glycan intermediate during N-glycan synthesis. The identified complex alleles were NM_019109.5(ALG1): c.[208 + 16_208 + 19dup; 208 + 25G > T] and NM_019109.5(ALG1): c.[208 + 16_208 + 19dup; 1312C > T]. Although both alleles carried the benign variant c.208 + 16_208 + 19dup, one allele carried a known ALG1 pathogenic variant (c.1312C > T), while the other carried a new uncharacterized variant (c.208 + 25G > T) causing non-functional alternative splicing that, in conjunction with the benign variant, defines the pathogenic protein effect (p.N70S_S71ins9). The presence in the patient’s serum of the pathognomonic N-linked mannose-deprived tetrasaccharide marker for ALG1-CDG (Neu5Acα2,6Galβ1,4-GlcNAcβ1,4GlcNAc) further supported this diagnosis. This is the first report of an ALG1-CDG patient from Latin America.
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Affiliation(s)
- Carlos Alberto González-Domínguez
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico.,Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico
| | - Moisés O Fiesco-Roa
- Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Médicas, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Ciudad Universitaria, Mexico City, Mexico.,Laboratorio de Citogenética, Instituto Nacional de Pediatría, Mexico City, Mexico
| | | | - Anke Paula Ingrid Kleinert-Altamirano
- Centro de Rehabilitación e Inclusión Infantil Teletón, Tuxtla Gutiérrez, Mexico.,Palmieri Metabolic Disease Laboratory, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA, United States
| | - Miao He
- Hospital Regional de Alta Especialidad Ciudad Salud, Tapachula, Mexico
| | | | - Kimiyo M Raymond
- Department of Laboratory Medicine and Pathology, Laboratory Genetics and Genomics, Mayo Clinic, Rochester, MN, United States
| | | | - Sandra Manrique-Hernández
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico.,Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico
| | - Ana González-Jaimes
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico
| | - Roberta Salinas-Marín
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico
| | - Carolina Molina-Garay
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Karol Carrillo-Sánchez
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Luis Leonardo Flores-Lagunes
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Marco Jiménez-Olivares
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Anallely Muñoz-Rivas
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Mario E Cruz-Muñoz
- Laboratorio de Inmunología Molecular, Facultad de Medicina, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico
| | - Matilde Ruíz-García
- Departamento de Neurología, Instituto Nacional de Pediatría, Mexico City, Mexico
| | - Hudson H Freeze
- Human Genetics Program, Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute, La Jolla, CA, United States
| | - Héctor M Mora-Montes
- Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Guanajuato, Mexico
| | - Carmen Alaez-Verson
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
| | - Iván Martínez-Duncker
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, Mexico.,Sociedad Latinoamericana de Glicobiología A.C., Cuernavaca, Mexico
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González-Domínguez C, Villarroel C, Rodríguez-Morales M, Manrique-Hernández S, González-Jaimes A, Olvera-Rodriguez F, Beutelspacher K, Molina-Garay C, Carrillo-Sánchez K, Flores-Lagunes L, Jiménez-Olivares M, Muñoz-Rivas A, Cruz-Muñoz M, Mora-Montes H, Salinas-Marín R, Alaez-Verson C, Martínez-Duncker I. Non-functional alternative splicing caused by a Latino pathogenic variant in a case of PMM2-CDG. Mol Genet Metab Rep 2021; 28:100781. [PMID: 34277356 PMCID: PMC8264207 DOI: 10.1016/j.ymgmr.2021.100781] [Citation(s) in RCA: 1] [Impact Index Per Article: 0.3] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Track Full Text] [Download PDF] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 04/30/2021] [Revised: 06/26/2021] [Accepted: 06/27/2021] [Indexed: 12/13/2022] Open
Abstract
We report on a Mexican mestizo with a multisystemic syndrome including neurological involvement and a type I serum transferrin isoelectric focusing (Tf IEF) pattern. Diagnosis of PMM2-CDG was obtained by clinical exome sequencing (CES) that revealed compound heterozygous variants in PMM2, the encoding gene for the phosphomannomutase 2 (PMM2). This enzyme catalyzes the conversion of mannose-6-P to mannose-1-P required for the synthesis of GDP-Man and Dol-P-Man, donor substrates for glycosylation reactions. The identified variants were c.422G>A (R141H) and c.178G>T, the former being the most frequent PMM2 pathogenic mutation and the latter a previously uncharacterized variant restricted to the Latino population with conflicting interpretations of pathogenicity and that we here report causes leaky non-functional alternative splicing (p.V60Cfs*3).
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Affiliation(s)
- C.A. González-Domínguez
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca 62209, Mexico
- Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico
| | - C.E. Villarroel
- Departamento de Genética, Instituto Nacional de Pediatría, Ciudad de México 04530, Mexico
| | - M. Rodríguez-Morales
- Departamento de Genética, Instituto Nacional de Pediatría, Ciudad de México 04530, Mexico
| | - S. Manrique-Hernández
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca 62209, Mexico
- Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico
| | - A. González-Jaimes
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca 62209, Mexico
| | - F. Olvera-Rodriguez
- Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico
| | - K. Beutelspacher
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca 62209, Mexico
| | - C. Molina-Garay
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Ciudad de México 14610, Mexico
| | - K. Carrillo-Sánchez
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Ciudad de México 14610, Mexico
| | - L.L. Flores-Lagunes
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Ciudad de México 14610, Mexico
| | - M. Jiménez-Olivares
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Ciudad de México 14610, Mexico
| | - A. Muñoz-Rivas
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Ciudad de México 14610, Mexico
| | - M.E. Cruz-Muñoz
- Laboratorio de Inmunología Molecular, Facultad de Medicina, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca 62209, Mexico
| | - H.M. Mora-Montes
- Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Campus Guanajuato, Universidad de Guanajuato, Guanajuato 36050, Mexico
| | - R. Salinas-Marín
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca 62209, Mexico
| | - C. Alaez-Verson
- Laboratorio de Diagnóstico Genómico, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaría de Salud, Ciudad de México 14610, Mexico
| | - I. Martínez-Duncker
- Laboratorio de Glicobiología Humana y Diagnóstico Molecular, Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca 62209, Mexico
- Corresponding author.
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