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Maldonado N, López-Hernández I, López-Cortés LE, Martínez Pérez-Crespo PM, Retamar-Gentil P, García-Montaner A, De la Rosa Riestra S, Sousa-Domínguez A, Goikoetxea J, Pulido-Navazo Á, Del Valle Ortíz M, Natera-Kindelán C, Jover-Sáenz A, Arco-Jiménez AD, Armiñanzas-Castillo C, Aller-García AI, Fernández-Suárez J, Marrodán-Ciordia T, Boix-Palop L, Smithson-Amat A, Reguera-Iglesias JM, Galán-Sánchez F, Bahamonde A, Sánchez-Calvo JM, Gea-Lázaro I, Pérez-Camacho I, Reyes-Bertos A, Becerril-Carral B, Pascual Á, Rodríguez-Baño J. Association of microbiological factors with mortality in Escherichia coli bacteraemia presenting with sepsis/septic shock: a prospective cohort study. Clin Microbiol Infect 2024:S1198-743X(24)00170-8. [PMID: 38599464 DOI: 10.1016/j.cmi.2024.04.001] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 02/18/2024] [Revised: 03/27/2024] [Accepted: 04/02/2024] [Indexed: 04/12/2024]
Abstract
OBJECTIVES This study aimed to determine the association of Escherichia coli microbiological factors with 30-day mortality in patients with bloodstream infection (BSI) presenting with a dysregulated response to infection (i.e. sepsis or septic shock). METHODS Whole-genome sequencing was performed on 224 E coli isolates of patients with sepsis/septic shock, from 22 Spanish hospitals. Phylogroup, sequence type, virulence, antibiotic resistance, and pathogenicity islands were assessed. A multivariable model for 30-day mortality including clinical and epidemiological variables was built, to which microbiological variables were hierarchically added. The predictive capacity of the models was estimated by the area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) with 95% confidence intervals (CI). RESULTS Mortality at day 30 was 31% (69 patients). The clinical model for mortality included (adjusted OR; 95% CI) age (1.04; 1.02-1.07), Charlson index ≥3 (1.78; 0.95-3.32), urinary BSI source (0.30; 0.16-0.57), and active empirical treatment (0.36; 0.11-1.14) with an AUROC of 0.73 (95% CI, 0.67-0.80). Addition of microbiological factors selected clone ST95 (3.64; 0.94-14.04), eilA gene (2.62; 1.14-6.02), and astA gene (2.39; 0.87-6.59) as associated with mortality, with an AUROC of 0.76 (0.69-0.82). DISCUSSION Despite having a modest overall contribution, some microbiological factors were associated with increased odds of death and deserve to be studied as potential therapeutic or preventive targets.
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Affiliation(s)
- Natalia Maldonado
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain
| | - Inmaculada López-Hernández
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain
| | - Luis Eduardo López-Cortés
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain
| | | | - Pilar Retamar-Gentil
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain
| | - Andrea García-Montaner
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain
| | - Sandra De la Rosa Riestra
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain
| | - Adrián Sousa-Domínguez
- Unidad de Enfermedades Infecciosas, Departamento de Medicina Interna, Complejo Hospitalario Universitario de Vigo, Spain
| | - Josune Goikoetxea
- Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario de Cruces, Baracaldo, Spain
| | | | | | - Clara Natera-Kindelán
- Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Unidad de Gestión Clínica de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario Reina Sofía, Córdoba, Spain
| | - Alfredo Jover-Sáenz
- Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario Arnau de Vilanova, Lleida, Spain
| | | | - Carlos Armiñanzas-Castillo
- Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario de Marqués de Valdecilla-IDIVAL, Santander, Spain
| | - Ana Isabel Aller-García
- Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen de Valme, Sevilla, Spain
| | - Jonathan Fernández-Suárez
- Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Central de Asturias. Oviedo, Spain. Área de Microbiología y Patología Infecciosa, Instituto de Investigación Sanitaria del Principado de Asturias (ISPA). Oviedo, Spain
| | | | - Lucía Boix-Palop
- Departamento de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario Mutua Terrassa, Terrassa, Spain
| | | | - José María Reguera-Iglesias
- Unidad de Gestión Clínica de Enfermedades Infecciosas, Hospital Regional Universitario de Málaga. Instituto de Investigación Biomédica de Málaga y Plataforma en Nanomedicina (IBIMA Plataforma BIONAND), Málaga, Spain
| | | | - Alberto Bahamonde
- Departamento de Medicina Interna, Hospital Universitario El Bierzo, Ponferrada, Spain
| | - Juan Manuel Sánchez-Calvo
- Unidad de Gestión Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica, Hospital Universitario de Jerez. Departamento de Biomedicina, Biotecnología y Salud Pública, Instituto de Investigación e Innovación Biomédica de Cádiz (INiBICA), Jerez de la Frontera, Spain
| | - Isabel Gea-Lázaro
- Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario de Jaén, Jaén, Spain
| | - Inés Pérez-Camacho
- Unidad de Medicina Tropical, Hospital Universitario Poniente-El Ejido, Almería, Spain
| | - Armando Reyes-Bertos
- Servicio de Microbiología, Unidad de Gestión Clínica de Laboratorio, Hospital Universitario Torrecárdenas, Almería, Spain
| | - Berta Becerril-Carral
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Punta de Europa, Algeciras, Spain
| | - Álvaro Pascual
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain
| | - Jesús Rodríguez-Baño
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain.
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Delgado-Valverde M, Valiente-Mendez A, Torres E, Almirante B, Gómez-Zorrilla S, Borrell N, Aller-García AI, Gurgui M, Almela M, Sanz M, Bou G, Martínez-Martínez L, Cantón R, Antonio Lepe J, Causse M, Gutiérrez-Gutiérrez B, Pascual Á, Rodríguez-Baño J. MIC of amoxicillin/clavulanate according to CLSI and EUCAST: discrepancies and clinical impact in patients with bloodstream infections due to Enterobacteriaceae. J Antimicrob Chemother 2018; 72:1478-1487. [PMID: 28093484 DOI: 10.1093/jac/dkw562] [Citation(s) in RCA: 7] [Impact Index Per Article: 1.2] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 08/17/2016] [Accepted: 12/02/2016] [Indexed: 11/12/2022] Open
Abstract
Objectives To compare results of amoxicillin/clavulanate susceptibility testing using CLSI and EUCAST methodologies and to evaluate their impact on outcome in patients with bacteraemia caused by Enterobacteriaceae. Patients and methods A prospective observational cohort study was conducted in 13 Spanish hospitals. Patients with bacteraemia due to Enterobacteriaceae who received empirical intravenous amoxicillin/clavulanate treatment for at least 48 h were included. MICs were determined following CLSI and EUCAST recommendations. Outcome variables were: failure at the end of treatment with amoxicillin/clavulanate (FEAMC); failure at day 21; and 30 day mortality. Classification and regression tree (CART) analysis and logistic regression were performed. Results Overall, 264 episodes were included; the urinary tract was the most common source (64.7%) and Escherichia coli the most frequent pathogen (76.5%). Fifty-two isolates (19.7%) showed resistance according to CLSI and 141 (53.4%) according to EUCAST. The kappa index for the concordance between the results of both committees was only 0.24. EUCAST-derived, but not CLSI-derived, MICs were associated with failure when considered as continuous variables. CART analysis suggested a 'resistance' breakpoint of > 8/4 mg/L for CLSI-derived MICs; it predicted FEAMC in adjusted analysis (OR = 1.96; 95% CI: 0.98-3.90). Isolates with EUCAST-derived MICs >16/2 mg/L independently predicted FEAMC (OR = 2.10; 95% CI: 1.05-4.21) and failure at day 21 (OR= 3.01; 95% CI: 0.93-9.67). MICs >32/2 mg/L were only predictive of failure among patients with bacteraemia from urinary or biliary tract sources. Conclusions CLSI and EUCAST methodologies showed low agreement for determining the MIC of amoxicillin/clavulanate. EUCAST-derived MICs seemed more predictive of failure than CLSI-derived ones. EUCAST-derived MICs >16/2 mg/L were independently associated with therapeutic failure.
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Affiliation(s)
- Mercedes Delgado-Valverde
- Unidad Clínica Intercentros de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Medicina Preventiva, Hospitales Universitarios Virgen Macarena y Virgen del Rocío-IBiS, Seville, Spain
| | - Adoración Valiente-Mendez
- Unidad Clínica Intercentros de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Medicina Preventiva, Hospitales Universitarios Virgen Macarena y Virgen del Rocío-IBiS, Seville, Spain
| | - Eva Torres
- Unidad Clínica Intercentros de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Medicina Preventiva, Hospitales Universitarios Virgen Macarena y Virgen del Rocío-IBiS, Seville, Spain
| | - Benito Almirante
- Departamento de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitari Vall d'Hebron, Barcelona, Spain
| | - Silvia Gómez-Zorrilla
- Servicio de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitari de Bellvitge-IDIBELL, Barcelona, Spain
| | - Nuria Borrell
- Servicio de Microbiología, Hospital Son Espases, Palma de Mallorca, Spain
| | - Ana Isabel Aller-García
- Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario de Valme, Seville, Spain
| | - Mercedes Gurgui
- Servicio de Enfermedades Infecciosas, Hospital de la Santa Creu i Sant Pau, Barcelona, Spain.,Facultad de Medicina, Universitat Autònomade Barcelona, Barcelona, Spain
| | - Manel Almela
- Servicio de Microbiología, Hospital Clínic, Barcelona, Spain
| | - Mercedes Sanz
- Departamento de Enfermedades Infecciosas, Hospital San Pedro-CIBIR, Logroño, Spain
| | - Germán Bou
- Servicio de Microbiología, Complejo Hospitalario Universitario A Coruña, A Coruña, Spain
| | - Luis Martínez-Martínez
- Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Marqués de Valdecilla-IDIVAL, Santander, Spain.,Departamento de Biología Molecular, Universidad de Cantabria, Santander, Spain
| | - Rafael Cantón
- Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal and Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain
| | - Jose Antonio Lepe
- Unidad Clínica Intercentros de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Medicina Preventiva, Hospitales Universitarios Virgen Macarena y Virgen del Rocío-IBiS, Seville, Spain
| | - Manuel Causse
- Unidad de Gestión Clínica de Microbiología, Hospital Universitario Reina Sofía-Instituto Maimónides de Investigación Biomédica de Córdoba (IMIBIC), Córdoba, Spain
| | - Belén Gutiérrez-Gutiérrez
- Unidad Clínica Intercentros de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Medicina Preventiva, Hospitales Universitarios Virgen Macarena y Virgen del Rocío-IBiS, Seville, Spain
| | - Álvaro Pascual
- Unidad Clínica Intercentros de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Medicina Preventiva, Hospitales Universitarios Virgen Macarena y Virgen del Rocío-IBiS, Seville, Spain.,Departamento de Microbiología, Universidad de Sevilla, Seville, Spain
| | - Jesús Rodríguez-Baño
- Unidad Clínica Intercentros de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Medicina Preventiva, Hospitales Universitarios Virgen Macarena y Virgen del Rocío-IBiS, Seville, Spain.,Departamento de Medicina, Universidad de Sevilla, Seville, Spain
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