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Aguilar-Granados A, Hernández-Macías B, Santiago-Martínez G, Ruiz-Medrano R, Kameyama-Kawabe L, Hinojosa-Moya J, Del Carmen Montes-Horcasitas M, Xoconostle-Cázares B. Genetic Diversity of Xylella fastidiosa in Mexican Vineyards. Plant Dis 2021; 105:1490-1494. [PMID: 33780269 DOI: 10.1094/pdis-09-20-1900-re] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 06/12/2023]
Abstract
Xylella fastidiosa is a xylem-inhabiting phytopathogenic bacterium that affects diverse agriculturally relevant crops. In Mexico, X. fastidiosa has been reported in the states of Baja California, Coahuila, and Querétaro. In order to determine the genetic diversity of this bacterium in Mexico, 408 grapevine samples were collected from the main producing states in México. For X. fastidiosa identification, real-time PCR and three-loci end-point PCR were employed. The genotyping of the subspecies was carried out using multilocus sequence typing and analysis, based on seven housekeeping genes: leuA, petC, malF, cysG, holC, nuoL, and gltT. The resulting sequences were compared with those present in extant databases. The presence of X. fastidiosa subsp. fastidiosa in the states of Baja California (sequence type 1), Coahuila (sequence type 1), and Querétaro was confirmed. The isolates from northern Mexico bear high similarity to grapevine isolates from the United States. However, the isolates from Querétaro showed significant differences with currently known sequences, showing that there is genetic variability among the X. fastidiosa subsp. fastidiosa populations from grapevines in northern and central Mexico.
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Affiliation(s)
- Andrés Aguilar-Granados
- Departamento de Biotecnología y Bioingeniería, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, Av. IPN 2508 San Pedro Zacatenco, 07360 CDMX, México
- Centro Nacional de Referencia Fitosanitaria, Servicio Nacional de Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria, Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural, 55740 Tecámac, Estado de México
| | - Bárbara Hernández-Macías
- Centro Nacional de Referencia Fitosanitaria, Servicio Nacional de Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria, Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural, 55740 Tecámac, Estado de México
| | - Guillermo Santiago-Martínez
- Centro Nacional de Referencia Fitosanitaria, Servicio Nacional de Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria, Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural, 55740 Tecámac, Estado de México
| | - Roberto Ruiz-Medrano
- Departamento de Biotecnología y Bioingeniería, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, Av. IPN 2508 San Pedro Zacatenco, 07360 CDMX, México
| | - Luis Kameyama-Kawabe
- Departamento de Genética y Biología Molecular, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, Av. IPN 2508 San Pedro Zacatenco, 07360 CDMX, México
| | - Jesús Hinojosa-Moya
- Facultad de Ingeniería Química, Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, Carr. Cañada Morelos Km 7.5 El Salado, Tecamachalco Puebla, México
| | - María Del Carmen Montes-Horcasitas
- Departamento de Biotecnología y Bioingeniería, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, Av. IPN 2508 San Pedro Zacatenco, 07360 CDMX, México
| | - Beatriz Xoconostle-Cázares
- Departamento de Biotecnología y Bioingeniería, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, Av. IPN 2508 San Pedro Zacatenco, 07360 CDMX, México
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