1
|
Tran Mau-Them F, Delanne J, Denommé-Pichon AS, Safraou H, Bruel AL, Vitobello A, Garde A, Nambot S, Bourgon N, Racine C, Sorlin A, Moutton S, Marle N, Rousseau T, Sagot P, Simon E, Vincent-Delorme C, Boute O, Colson C, Petit F, Legendre M, Naudion S, Rooryck C, Prouteau C, Colin E, Guichet A, Ziegler A, Bonneau D, Morel G, Fradin M, Lavillaureix A, Quelin C, Pasquier L, Odent S, Vera G, Goldenberg A, Guerrot AM, Brehin AC, Putoux A, Attia J, Abel C, Blanchet P, Wells CF, Deiller C, Nizon M, Mercier S, Vincent M, Isidor B, Amiel J, Dard R, Godin M, Gruchy N, Jeanne M, Schaeffer E, Maillard PY, Payet F, Jacquemont ML, Francannet C, Sigaudy S, Bergot M, Tisserant E, Ascencio ML, Binquet C, Duffourd Y, Philippe C, Faivre L, Thauvin-Robinet C. Prenatal diagnosis by trio exome sequencing in fetuses with ultrasound anomalies: A powerful diagnostic tool. Front Genet 2023; 14:1099995. [PMID: 37035737 PMCID: PMC10076577 DOI: 10.3389/fgene.2023.1099995] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 11/16/2022] [Accepted: 02/24/2023] [Indexed: 04/11/2023] Open
Abstract
Introduction: Prenatal ultrasound (US) anomalies are detected in around 5%-10% of pregnancies. In prenatal diagnosis, exome sequencing (ES) diagnostic yield ranges from 6% to 80% depending on the inclusion criteria. We describe the first French national multicenter pilot study aiming to implement ES in prenatal diagnosis following the detection of anomalies on US. Patients and methods: We prospectively performed prenatal trio-ES in 150 fetuses with at least two US anomalies or one US anomaly known to be frequently linked to a genetic disorder. Trio-ES was only performed if the results could influence pregnancy management. Chromosomal microarray (CMA) was performed before or in parallel. Results: A causal diagnosis was identified in 52/150 fetuses (34%) with a median time to diagnosis of 28 days, which rose to 56/150 fetuses (37%) after additional investigation. Sporadic occurrences were identified in 34/56 (60%) fetuses and unfavorable vital and/or neurodevelopmental prognosis was made in 13/56 (24%) fetuses. The overall diagnostic yield was 41% (37/89) with first-line trio-ES versus 31% (19/61) after normal CMA. Trio-ES and CMA were systematically concordant for identification of pathogenic CNV. Conclusion: Trio-ES provided a substantial prenatal diagnostic yield, similar to postnatal diagnosis with a median turnaround of approximately 1 month, supporting its routine implementation during the detection of prenatal US anomalies.
Collapse
Affiliation(s)
- Frédéric Tran Mau-Them
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
- *Correspondence: Frédéric Tran Mau-Them,
| | - Julian Delanne
- Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs”, Centre de Génétique, FHU TRANSLAD et Institut GIMI, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Anne-Sophie Denommé-Pichon
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
| | - Hana Safraou
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
| | - Ange-Line Bruel
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
| | - Antonio Vitobello
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
| | - Aurore Garde
- Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs”, Centre de Génétique, FHU TRANSLAD et Institut GIMI, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Sophie Nambot
- Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs”, Centre de Génétique, FHU TRANSLAD et Institut GIMI, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Nicolas Bourgon
- Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs”, Centre de Génétique, FHU TRANSLAD et Institut GIMI, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Caroline Racine
- Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs”, Centre de Génétique, FHU TRANSLAD et Institut GIMI, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Arthur Sorlin
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
- Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs”, Centre de Génétique, FHU TRANSLAD et Institut GIMI, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Sébastien Moutton
- Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs”, Centre de Génétique, FHU TRANSLAD et Institut GIMI, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Nathalie Marle
- Laboratoire Génétique Chromosomique et Moléculaire, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Thierry Rousseau
- Service de Gynécologie Obstétrique, Médecine Fœtale et Stérilité Conjugale, Centre Hospitalier Universitaire Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Paul Sagot
- Service de Gynécologie Obstétrique, Médecine Fœtale et Stérilité Conjugale, Centre Hospitalier Universitaire Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Emmanuel Simon
- Service de Gynécologie Obstétrique, Médecine Fœtale et Stérilité Conjugale, Centre Hospitalier Universitaire Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Catherine Vincent-Delorme
- CHU Lille, Clinique de Génétique Guy Fontaine, Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs” Nord-Ouest, FLille, France
| | - Odile Boute
- CHU Lille, Clinique de Génétique Guy Fontaine, Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs” Nord-Ouest, FLille, France
| | - Cindy Colson
- CHU Lille, Clinique de Génétique Guy Fontaine, Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs” Nord-Ouest, FLille, France
| | - Florence Petit
- CHU Lille, Clinique de Génétique Guy Fontaine, Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs” Nord-Ouest, FLille, France
| | - Marine Legendre
- CHU de Bordeaux, Service de Génétique Médicale, Bordeaux, France
| | - Sophie Naudion
- CHU de Bordeaux, Service de Génétique Médicale, Bordeaux, France
| | - Caroline Rooryck
- CHU de Bordeaux, Service de Génétique Médicale, Bordeaux, France
| | - Clément Prouteau
- Biochemistry and Genetics Department, University Hospital of Angers, Angers, France
| | - Estelle Colin
- Biochemistry and Genetics Department, University Hospital of Angers, Angers, France
| | - Agnès Guichet
- Biochemistry and Genetics Department, University Hospital of Angers, Angers, France
| | - Alban Ziegler
- Biochemistry and Genetics Department, University Hospital of Angers, Angers, France
| | - Dominique Bonneau
- Biochemistry and Genetics Department, University Hospital of Angers, Angers, France
| | - Godelieve Morel
- Service de Génétique Clinique, Centre de Référence Maladies Rares CLAD-Ouest, CHU Hôpital Sud, Rennes, France
| | - Mélanie Fradin
- Service de Génétique Clinique, Centre de Référence Maladies Rares CLAD-Ouest, CHU Hôpital Sud, Rennes, France
| | - Alinoé Lavillaureix
- Service de Génétique Clinique, Centre de Référence Maladies Rares CLAD-Ouest, CHU Hôpital Sud, Rennes, France
| | - Chloé Quelin
- Service de Génétique Clinique, Centre de Référence Maladies Rares CLAD-Ouest, CHU Hôpital Sud, Rennes, France
| | - Laurent Pasquier
- Service de Génétique Clinique, Centre de Référence Maladies Rares CLAD-Ouest, CHU Hôpital Sud, Rennes, France
| | - Sylvie Odent
- Service de Génétique Clinique, Centre de Référence Maladies Rares CLAD-Ouest, CHU Hôpital Sud, Rennes, France
| | - Gabriella Vera
- Service de Génétique—Unité de Génétique Clinique, Rouen, France
| | | | | | | | - Audrey Putoux
- Service de Génétique—GH Est-Hôpital Femme Mère Enfant, Lyon, France
| | | | - Carine Abel
- Service de Génétique et Centre de Diagnostic Anténatal, CHU de Lyon HCL—GH Nord-Hôpital de La Croix Rousse, Lyon, France
| | - Patricia Blanchet
- Equipe Maladies Génétiques de L’Enfant et de L’Adulte, Département Génétique Médicale, Maladies Rares et Médecine Personnalisée, CHU de Montpellier, University Montpellier, Montpellier, France
| | - Constance F. Wells
- Equipe Maladies Génétiques de L’Enfant et de L’Adulte, Département Génétique Médicale, Maladies Rares et Médecine Personnalisée, CHU de Montpellier, University Montpellier, Montpellier, France
| | - Caroline Deiller
- Equipe Maladies Génétiques de L’Enfant et de L’Adulte, Département Génétique Médicale, Maladies Rares et Médecine Personnalisée, CHU de Montpellier, University Montpellier, Montpellier, France
| | - Mathilde Nizon
- CHU Nantes, Service de Génétique Médicale, Nantes, France
- Institut Du Thorax, INSERM, CNRS, UNIV Nantes, Nantes, France
| | - Sandra Mercier
- CHU Nantes, Service de Génétique Médicale, Nantes, France
- Institut Du Thorax, INSERM, CNRS, UNIV Nantes, Nantes, France
| | - Marie Vincent
- CHU Nantes, Service de Génétique Médicale, Nantes, France
- Institut Du Thorax, INSERM, CNRS, UNIV Nantes, Nantes, France
| | - Bertrand Isidor
- CHU Nantes, Service de Génétique Médicale, Nantes, France
- Institut Du Thorax, INSERM, CNRS, UNIV Nantes, Nantes, France
| | - Jeanne Amiel
- Equipe “Embryologie et Génétiques des Malformations Congénitales", Institut Imagine—INSERM U1163, Institut des Maladies Génétiques, Paris, France
- Service de Génétique Médicale et Clinique, Hôpital Necker-Enfants Malades, Paris, France
| | - Rodolphe Dard
- Unité Fonctionnelle de Génétique Médicale, Cytogénétique, Génétique Médicale et Biologie de La Reproduction, Centre Hospitalier Intercommunal Poissy-Saint-Germain-en-Laye, Poissy, France
| | - Manon Godin
- Service de Génétique, CHU Caen Clemenceau, EA 7450 Biotargen, University Caen, Caen, France
| | - Nicolas Gruchy
- Service de Génétique, CHU Caen Clemenceau, EA 7450 Biotargen, University Caen, Caen, France
| | - Médéric Jeanne
- Service de Génétique, CHU de Tours, Tours, France
- UMR 1253, IBrain, Université de Tours, Inserm, Tours, France
| | - Elise Schaeffer
- Service de Génétique Médicale, CHU de Strasbourg—Hôpital de Hautepierre, Strasbourg, France
| | - Pierre-Yves Maillard
- Service de Génétique Médicale, CHU de Strasbourg—Hôpital de Hautepierre, Strasbourg, France
| | - Frédérique Payet
- Service de Génétique Médicale, Pôle Femme, Mère, Enfants CHU de La Réunion—GH Sud Réunion—Saint-Pierre, Saint-Pierre, France
| | - Marie-Line Jacquemont
- Service de Génétique Médicale, Pôle Femme, Mère, Enfants CHU de La Réunion—GH Sud Réunion—Saint-Pierre, Saint-Pierre, France
| | - Christine Francannet
- Service de Génétique Médicale, Pôle Femme et Enfant, CHU de Clermont-Ferrand—Hôpital D'Estaing, Clermont-Ferrand, France
| | - Sabine Sigaudy
- Unité de Génétique Clinique Prénatale, Département de Génétique Médicale, CHU de Marseille—Hôpital de La Timone, Marseille, France
| | - Marine Bergot
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
| | | | - Marie-Laure Ascencio
- Centre D'Investigation Clinique CIC-EC Inserm CIC1432, UFR des Sciences de Santé, Université de Bourgogne-Franche-Comté, Dijon, France
| | - Christine Binquet
- Centre D'Investigation Clinique CIC-EC Inserm CIC1432, UFR des Sciences de Santé, Université de Bourgogne-Franche-Comté, Dijon, France
| | - Yannis Duffourd
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
| | - Christophe Philippe
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
| | - Laurence Faivre
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
- Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs”, Centre de Génétique, FHU TRANSLAD et Institut GIMI, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Christel Thauvin-Robinet
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- INSERM UMR1231 GAD, F-21000, Dijon, France
- Centre de Référence Maladies Rares “Anomalies Du Développement et Syndromes Malformatifs”, Centre de Génétique, FHU TRANSLAD et Institut GIMI, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| |
Collapse
|
2
|
Deiller C, Van-Gils J, Zordan C, Tinat J, Loiseau H, Fabre T, Delleci C, Cohen J, Vidaud M, Parfait B, Goizet C. Coexistence of schwannomatosis and glioblastoma in two families. Eur J Med Genet 2019; 62:103680. [PMID: 31128261 DOI: 10.1016/j.ejmg.2019.103680] [Citation(s) in RCA: 9] [Impact Index Per Article: 1.8] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 10/29/2018] [Revised: 02/20/2019] [Accepted: 05/19/2019] [Indexed: 01/07/2023]
Abstract
Schwannomatosis is a rare affection predisposing to multiple peripheral neurologic tumors development. Approximatively, one third of patients with schwannomatosis are carriers of a germline mutation in LZTR1 (Leucin Zipper Transcription Regulator 1). Tumorigenesis in schwannomatosis responds to a somatic 5-hit/3-step mechanism resulting in a loss of function (LOF) of LZTR1 and the contiguous genes of locus 22q11.2q12.2. Effectively, LZTR1 is mapped on 22q11.2 and centromeric to SMARCB1 also implicated in the determinism of schwannomatosis and NF2, responsible for neurofibromatosis type 2. On a somatic point of view, LZTR1 mutations are known to drive with a significant frequency glioblastoma (GB) development. We report here two families in which segregate both multiple schwannomas and GB. In the first family, the proband received a diagnosis with of schwannomatosis after a surgery for a lumbar schwannoma at age 43, molecularly confirmed by identification of a germline heterozygous mutation in LZTR1. Her father, having unremarkable medical history deceased from an apparently isolated GB at age 59. In the second family, LZTR1-related schwannomatosis was diagnosed in the index case at age 70 after multiple schwannomas surgeries. Her elder sister had no neurological medical history before occurrence of a lethal GB at age 78. Molecular analysis of GB sample from both affected relatives showed the presence of the familial mutation. These observations hypothesize a potential link between schwannomatosis and the GB development.
Collapse
Affiliation(s)
| | - Julien Van-Gils
- CHU Bordeaux, Service de Génétique Médicale, Bordeaux, France; Laboratoire MRGM, INSERM U1211, Univ. Bordeaux, Bordeaux, France.
| | - Cécile Zordan
- CHU Bordeaux, Service de Génétique Médicale, Bordeaux, France
| | - Julie Tinat
- CHU Bordeaux, Service de Génétique Médicale, Bordeaux, France
| | - Hugues Loiseau
- CHU Bordeaux, Service de Neurochirurgie, Bordeaux, France
| | - Thierry Fabre
- CHU Bordeaux, Service d'orthopédie, Bordeaux, France
| | - Claire Delleci
- CHU Bordeaux, Service de Médecine Physique et Réadaptation, Bordeaux, France
| | - Joëlle Cohen
- Service de Génétique et Biologie Moléculaires, Hôpital Cochin, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Michel Vidaud
- Service de Génétique et Biologie Moléculaires, Hôpital Cochin, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France; UMR INSERM 1016, Institut Cochin, Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Béatrice Parfait
- Service de Génétique et Biologie Moléculaires, Hôpital Cochin, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France; UMR INSERM 1016, Institut Cochin, Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Paris, France
| | - Cyril Goizet
- CHU Bordeaux, Service de Génétique Médicale, Bordeaux, France; Laboratoire MRGM, INSERM U1211, Univ. Bordeaux, Bordeaux, France
| |
Collapse
|