Molecular Characterization of Giardia intestinalis and Cryptosporidium spp. Detected in Humans in Ağrı, Türkiye

Background

We aimed to determine the prevalence of Giardia intestinalis and Cryptosporidium spp. in patients who admitted hospital with diarrhea and to gain information about the transmission of these parasites in Ağrı, Türkiye.

Methods

This study included 184 patients who applied to Ağrı-Diyadin State Hospital, Türkiye in 2022. The immunochromatographic card test was used for detection of the G. intestinalis and Cryptosporidium spp. Nested PCR-RFLP analysis of the COWP gene and sequence analysis of the gp60 gene were used to genotype and subtype Cryptosporidium spp., whereas Nested PCR and sequence analyses of β-giardin gene were used genotype G. intestinalis.

Results

Of the 184 stool specimens examined, 12 (14.29%) and 7 (3.80%) were positive for G. intestinalis and Cryptosporidium spp., respectively. The Cryptosporidium species were identified as C. parvum belonging to the IId sub-type family. The G. intestinalis were identified assemblages A.

Conclusion

Assemblage A, which is associated with diarrhea, is responsible for giardiasis and C. parvum IId subtype, often found in sheep, goats and cattle, is responsible for cryptosporidiosis in Ağrı, Türkiye.

The expression levels of virulence and antibiotic resistance genes in Lactococcus garvieae exposed to different conditions

Lactococcus garvieae, balıkların hemorajik septisemisi olan laktokokkozun etken maddesidir. Laktokkoz, ticari açıdan önemli birçok tatlı su ve deniz türünü etkilediği için su ürünleri yetiştiriciliğinde önemli ekonomik kayıplara neden olur. Bu çalışmada çalışmada kullanılan bakterilerin biyokimyasal testlerde %92,5 oranında tespit edildiği görülmüştür. Çalışmada kullanılan L. garvieae etkeninin Gentamisin, Tobramisin, Sefoksitin, Penisilin G, Amoksisilin-Klavulanat, Trimetoprim-Sülfametoksazol, Klindamisin, Fusidik Asit ve Rifampine dirençli olduğu da gözlendi . L. garvieae etkeninin optimum büyüme sıcaklığı 21 o alındığındaC'de kontrol grubu için virülans gen ekspresyon düzeyi ajanın en iyi gelişebileceği sıcaklık aralığı olan 25 ve 37°C'de yukarı, 15°C ve 45°C'de ise aşağı yönlü düzenlenmiştir. Benzer şekilde 25°C'ye en yakın sıcaklıkta üreyen bakterilerde gen ekspresyon düzeyinin antibiyotik direnç geni ekspresyon düzeyinde 21°C kontrol grubuna göre, bakterilerin ekspresyon düzeylerinde ise anlamlı düzeyde yukarı regüle olduğu gözlendi. diğer sıcaklıklarda büyüme daha düşüktü. Bu sonuçlar dikkate alındığında, çalışmada kullanılan bakteri gökkuşağı alabalığından izole edildiğinden, sıcaklığın virülans üzerindeki etkisinin önemli ölçüde etkili olduğu anlaşılmaktadır.