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Coustillères F, Renault V, Corvec S, Dupieux C, Simões PM, Lartigue MF, Plouzeau-Jayle C, Tande D, Lamoureux C, Lemarié C, Chenouard R, Laurent F, Lemaignen A, Bémer P. Clinical, Bacteriological, and Genetic Characterization of Bone and Joint Infections Involving Linezolid-Resistant Staphylococcus epidermidis: a Retrospective Multicenter Study in French Reference Centers. Microbiol Spectr 2023; 11:e0419022. [PMID: 37133395 PMCID: PMC10269892 DOI: 10.1128/spectrum.04190-22] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 10/29/2022] [Accepted: 04/09/2023] [Indexed: 05/04/2023] Open
Abstract
The choice of the best probabilistic postoperative antibiotics in bone and joint infections (BJIs) is still challenging. Since the implementation of protocolized postoperative linezolid in six French referral centers, linezolid-resistant multidrug-resistant Staphylococcus epidermidis (LR-MDRSE) strains were isolated in patients with BJI. We aimed here to describe clinical, microbiological, and molecular patterns associated with these strains. All patients with at least one intraoperative specimen positive for LR-MDRSE between 2015 and 2020 were included in this retrospective multicenter study. Clinical presentation, management, and outcome were described. LR-MDRSE strains were investigated by MIC determination for linezolid and other anti-MRSA antibiotics, characterization of genetic determinants of resistance, and phylogenetic analysis. Forty-six patients (colonization n = 10, infection n = 36) were included in five centers, 45 had prior exposure to linezolid, 33 had foreign devices. Clinical success was achieved for 26/36 patients. Incidence of LR-MDRSE increased over the study period. One hundred percent of the strains were resistant to oxazolidinones, gentamicin, clindamycin, ofloxacin, rifampicin, ceftaroline, and ceftobiprole, and susceptible to cyclins, daptomycin, and dalbavancin. Susceptibility to delafloxacin was bimodal. Molecular analysis was performed for 44 strains, and the main mutation conferring linezolid resistance was the 23S rRNA G2576T mutation. All strains belonged to the sequence type ST2 or its clonal complex, and phylogenetic analysis showed emergence of five populations corresponding geographically to the centers. We showed the emergence of new clonal populations of highly linezolid-resistant S. epidermidis in BJIs. Identifying patients at risk for LR-MDRSE acquisition and proposing alternatives to systematic postoperative linezolid use are essential. IMPORTANCE The manuscript describes the emergence of clonal linezolid-resistant strains of Staphylococcus epidermidis (LR-MDRSE) isolated from patients presenting with bone and joint infections. Incidence of LR-MDRSE increased over the study period. All strains were highly resistant to oxazolidinones, gentamicin, clindamycin, ofloxacin, rifampicin, ceftaroline, and ceftobiprole, but were susceptible to cyclins, daptomycin, and dalbavancin. Susceptibility to delafloxacin was bimodal. The main mutation conferring linezolid resistance was the 23S rRNA G2576T mutation. All strains belonged to the sequence type ST2 or its clonal complex, and phylogenetic analysis showed emergence of five populations corresponding geographically to the centers. LR-MDRSE bone and joint infections seem to be accompanied by an overall poor prognosis related to comorbidities and therapeutic issues. Identifying patients at risk for LR-MDRSE acquisition and proposing alternatives to systematic postoperative linezolid use become essential, with a preference for parenteral drugs such as lipopeptids or lipoglycopeptids.
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Affiliation(s)
- François Coustillères
- Service des Maladies Infectieuses, Centre Hospitalier Régional Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Tours, France
| | - Victor Renault
- Service de Bactériologie et des Contrôles microbiologiques, Hôtel-Dieu, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Nantes, France
| | - Stéphane Corvec
- Service de Bactériologie et des Contrôles microbiologiques, Hôtel-Dieu, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Nantes, France
| | - Céline Dupieux
- Hospices Civils de Lyon, Institut des Agents Infectieux, Service de Bactériologie, Centre National de Référence des Staphylocoques, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOAC Lyon), France
| | - Patricia Martins Simões
- Hospices Civils de Lyon, Institut des Agents Infectieux, Service de Bactériologie, Centre National de Référence des Staphylocoques, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOAC Lyon), France
| | - Marie Frédérique Lartigue
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Régional Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Tours, France
| | - Chloé Plouzeau-Jayle
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Poitiers, France
| | - Didier Tande
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Brest, France
| | - Claudie Lamoureux
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Brest, France
| | - Carole Lemarié
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Angers, France
| | - Rachel Chenouard
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Angers, France
| | - Frédéric Laurent
- Hospices Civils de Lyon, Institut des Agents Infectieux, Service de Bactériologie, Centre National de Référence des Staphylocoques, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOAC Lyon), France
| | - Adrien Lemaignen
- Service des Maladies Infectieuses, Centre Hospitalier Régional Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Tours, France
| | - Pascale Bémer
- Service de Bactériologie et des Contrôles microbiologiques, Hôtel-Dieu, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Nantes, France
| | - the CRIOGO (Centre de Référence des Infections Ostéo-articulaires du Grand Ouest) Study Team
- Service des Maladies Infectieuses, Centre Hospitalier Régional Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Tours, France
- Service de Bactériologie et des Contrôles microbiologiques, Hôtel-Dieu, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Nantes, France
- Hospices Civils de Lyon, Institut des Agents Infectieux, Service de Bactériologie, Centre National de Référence des Staphylocoques, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOAC Lyon), France
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Régional Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Tours, France
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Poitiers, France
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Brest, France
- Service de Bactériologie et d’Hygiène, Centre Hospitalier Universitaire, Centre Régional de Référence pour la prise en charge des IOA complexes (CRIOGO), Angers, France
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