Discovery of an orally active benzoxaborole prodrug effective in the treatment of Chagas disease in non-human primates

Trypanosoma cruzi, the agent of Chagas disease, probably infects tens of millions of people, primarily in Latin America, causing morbidity and mortality. The options for treatment and prevention of Chagas disease are limited and underutilized. Here we describe the discovery of a series of benzoxaborole compounds with nanomolar activity against extra- and intracellular stages of T. cruzi. Leveraging both ongoing drug discovery efforts in related kinetoplastids, and the exceptional models for rapid drug screening and optimization in T. cruzi, we have identified the prodrug AN15368 that is activated by parasite carboxypeptidases to yield a compound that targets the messenger RNA processing pathway in T. cruzi. AN15368 was found to be active in vitro and in vivo against a range of genetically distinct T. cruzi lineages and was uniformly curative in non-human primates (NHPs) with long-term naturally acquired infections. Treatment in NHPs also revealed no detectable acute toxicity or long-term health or reproductive impact. Thus, AN15368 is an extensively validated and apparently safe, clinically ready candidate with promising potential for prevention and treatment of Chagas disease.

DNDI-6148: A Novel Benzoxaborole Preclinical Candidate for the Treatment of Visceral Leishmaniasis

Visceral leishmaniasis (VL) is a parasitic disease endemic across multiple regions of the world and is fatal if untreated. Current therapies are unsuitable, and there is an urgent need for safe, short-course, and low-cost oral treatments to combat this neglected disease. The benzoxaborole chemotype has previously delivered clinical candidates for the treatment of other parasitic diseases. Here, we describe the development and optimization of this series, leading to the identification of compounds with potent in vitro and in vivo antileishmanial activity. The lead compound (DNDI-6148) combines impressive in vivo efficacy (>98% reduction in parasite burden) with pharmaceutical properties suitable for onward development and an acceptable safety profile. Detailed mode of action studies confirm that DNDI-6148 acts principally through the inhibition of Leishmania cleavage and polyadenylation specificity factor (CPSF3) endonuclease. As a result of these studies and its promising profile, DNDI-6148 has been declared a preclinical candidate for the treatment of VL.

Veterinary trypanocidal benzoxaboroles are peptidase-activated prodrugs

Livestock diseases caused by Trypanosoma congolense, T. vivax and T. brucei, collectively known as nagana, are responsible for billions of dollars in lost food production annually. There is an urgent need for novel therapeutics. Encouragingly, promising antitrypanosomal benzoxaboroles are under veterinary development. Here, we show that the most efficacious subclass of these compounds are prodrugs activated by trypanosome serine carboxypeptidases (CBPs). Drug-resistance to a development candidate, AN11736, emerged readily in T. brucei, due to partial deletion within the locus containing three tandem copies of the CBP genes. T. congolense parasites, which possess a larger array of related CBPs, also developed resistance to AN11736 through deletion within the locus. A genome-scale screen in T. brucei confirmed CBP loss-of-function as the primary mechanism of resistance and CRISPR-Cas9 editing proved that partial deletion within the locus was sufficient to confer resistance. CBP re-expression in either T. brucei or T. congolense AN11736-resistant lines restored drug-susceptibility. CBPs act by cleaving the benzoxaborole AN11736 to a carboxylic acid derivative, revealing a prodrug activation mechanism. Loss of CBP activity results in massive reduction in net uptake of AN11736, indicating that entry is facilitated by the concentration gradient created by prodrug metabolism.

Recommandations Formalisées d’Experts SRLF/SFMU : Prise en charge des états de mal épileptiques en préhospitalier, en structure d’urgence et en réanimation dans les 48 premières heures (A l’exclusion du nouveau-né et du nourrisson)

La Société de réanimation de langue française et la Société française de médecine d’urgence ont décidé d’élaborer de nouvelles recommandations sur la prise en charge de l’état mal épileptique (EME) avec l’ambition de répondre le plus possible aux nombreuses questions pratiques que soulèvent les EME : diagnostic, enquête étiologique, traitement non spécifique et spécifique. Vingt-cinq experts ont analysé la littérature scientifique et formulé des recommandations selon la méthodologie GRADE. Les experts se sont accordés sur 96 recommandations. Les recommandations avec le niveau de preuve le plus fort ne concernent que l’EME tonico-clonique généralisé (EMTCG) : l’usage des benzodiazépines en première ligne (clonazépam en intraveineux direct ou midazolam en intramusculaire) est recommandé, répété 5 min après la première injection (à l’exception du midazolam) en cas de persistance clinique. En cas de persistance 5 min après cette seconde injection, il est proposé d’administrer la seconde ligne thérapeutique : valproate de sodium, (fos-)phénytoïne, phénobarbital ou lévétiracétam. La persistance avérée de convulsions 30 min après le début de l’administration du traitement de deuxième ligne signe l’EMETCG réfractaire. Il est alors proposé de recourir à un coma thérapeutique au moyen d’un agent anesthésique intraveineux de type midazolam ou propofol. Des recommandations spécifiques à l’enfant et aux autres EME sont aussi énoncées.

Développement d’un outil d’évaluation des compétences des étudiants en médecine d’urgence : une étude nationale par la méthode Delphi

Objectif : Ce travail s’inscrit dans une démarche d’ingénierie des compétences visant à évaluer par la simulation les étudiants et les internes en médecine d’urgence (MU). L’objectif de l’étude est de développer un score d’évaluation par la simulation pour trois familles de situation (FS).

Matériels et méthodes : Le choix des trois FS a été fait après un classement selon leur importance, réalisé par les coordonnateurs régionaux du diplôme d’études spécialisé de MU. La seconde étape consistait en une méthode Delphi, pour élaborer une grille d’évaluation des étudiants sur ces FS. Parmi les 86 experts sollicités, l’objectif était d’avoir 20 experts pour chaque FS, qui devraient noter des items en fonction de leur pertinence à évaluer, sur une échelle de Likert pour le premier et le deuxième tour puis sur un score binaire au tour final. Le consensus a priori était de 75 % pour les deux premiers tours puis de 85 % pour le dernier tour.

Résultats : Les trois FS identifiées sont l’arrêt cardiorespiratoire, la détresse respiratoire aiguë et le coma non traumatique. Cinquante et un experts ont accepté de participer (59 %). Le taux de participation a varié de 80 à 95 % pour chaque tour, et les experts ont identifié 20 catégories composant un score d’évaluation pour chaque situation.

Conclusion : Grâce à une méthode de consensus de groupe, nous avons pu déterminer les items indispensables à l’évaluation en simulation de trois situations cliniques graves en MU.

Influence de l’âge sur les durées de réanimation des arrêts cardiaques préhospitaliers

Introduction : L’objectif de notre étude est de déterminer si l’âge des patients en arrêt cardiaque (AC) a une influence sur les durées de réanimation cardiopulmonaire (RCP) par les équipes préhospitalières.

Patients et méthodes : Nous avons réalisé une étude monocentrique, prospective, à partir des données de notre centre hospitalier universitaire, issues du Registre électronique des arrêts cardiaques. Ont été inclus tous les patients ayant présenté un AC, hormis ceux retrouvés en état de rigidité cadavérique ou qui avaient préalablement exprimé des directives anticipées sur leur fin de vie. Les patients ont été séparés en deux groupes selon leur âge : les moins de 75 ans et ceux de 75 ans et plus. Le critère de jugement principal était la durée de RCP spécialisée décidée par le médecin de l’équipe préhospitalière.

Résultats : Du 1er janvier au 31 décembre 2015, sur 253 patients victimes d’AC, 188 (74 % d’hommes, 78 % d’asystolie) ont bénéficié d’une RCP par une équipe du Service mobile d’urgence et de réanimation. Il y a eu 39 % de récupération d’une activité cardiaque spontanée (RACS). Seuls 31 % des patients étaient admis vivants à l’hôpital, ils étaient 6 % à j30. La durée de RCP était plus importante pour les patients de moins de 75 ans (29 ± 15 vs 23 ± 19 minutes ; p < 0,01). Mais pour les patients ayant une RACS, la durée de RCP était identique entre les deux groupes (16 ± 10 vs 14 ± 9 minutes ; p = 0,34). La survie des patients de 75 ans et plus était de 10 vs 22 % pour les moins de 75 ans (p = 0,35).

Conclusion : Notre étude suggère que l’âge des patients influence négativement les durées de réanimation des équipes préhospitalières.

The trypanocidal benzoxaborole AN7973 inhibits trypanosome mRNA processing

Kinetoplastid parasites-trypanosomes and leishmanias-infect millions of humans and cause economically devastating diseases of livestock, and the few existing drugs have serious deficiencies. Benzoxaborole-based compounds are very promising potential novel anti-trypanosomal therapies, with candidates already in human and animal clinical trials. We investigated the mechanism of action of several benzoxaboroles, including AN7973, an early candidate for veterinary trypanosomosis. In all kinetoplastids, transcription is polycistronic. Individual mRNA 5'-ends are created by trans splicing of a short leader sequence, with coupled polyadenylation of the preceding mRNA. Treatment of Trypanosoma brucei with AN7973 inhibited trans splicing within 1h, as judged by loss of the Y-structure splicing intermediate, reduced levels of mRNA, and accumulation of peri-nuclear granules. Methylation of the spliced leader precursor RNA was not affected, but more prolonged AN7973 treatment caused an increase in S-adenosyl methionine and methylated lysine. Together, the results indicate that mRNA processing is a primary target of AN7973. Polyadenylation is required for kinetoplastid trans splicing, and the EC50 for AN7973 in T. brucei was increased three-fold by over-expression of the T. brucei cleavage and polyadenylation factor CPSF3, identifying CPSF3 as a potential molecular target. Molecular modeling results suggested that inhibition of CPSF3 by AN7973 is feasible. Our results thus chemically validate mRNA processing as a viable drug target in trypanosomes. Several other benzoxaboroles showed metabolomic and splicing effects that were similar to those of AN7973, identifying splicing inhibition as a common mode of action and suggesting that it might be linked to subsequent changes in methylated metabolites. Granule formation, splicing inhibition and resistance after CPSF3 expression did not, however, always correlate and prolonged selection of trypanosomes in AN7973 resulted in only 1.5-fold resistance. It is therefore possible that the modes of action of oxaboroles that target trypanosome mRNA processing might extend beyond CPSF3 inhibition.

Benzoxaborole treatment perturbs S-adenosyl-L-methionine metabolism in Trypanosoma brucei

The parasitic protozoan Trypanosoma brucei causes Human African Trypanosomiasis and Nagana in other mammals. These diseases present a major socio-economic burden to large areas of sub-Saharan Africa. Current therapies involve complex and toxic regimens, which can lead to fatal side-effects. In addition, there is emerging evidence for drug resistance. AN5568 (SCYX-7158) is a novel benzoxaborole class compound that has been selected as a lead compound for the treatment of HAT, and has demonstrated effective clearance of both early and late stage trypanosomiasis in vivo. The compound is currently awaiting phase III clinical trials and could lead to a novel oral therapeutic for the treatment of HAT. However, the mode of action of AN5568 in T. brucei is unknown. This study aimed to investigate the mode of action of AN5568 against T. brucei, using a combination of molecular and metabolomics-based approaches.Treatment of blood-stage trypanosomes with AN5568 led to significant perturbations in parasite metabolism. In particular, elevated levels of metabolites involved in the metabolism of S-adenosyl-L-methionine, an essential methyl group donor, were found. Further comparative metabolomic analyses using an S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase inhibitor, sinefungin, showed the presence of several striking metabolic phenotypes common to both treatments. Furthermore, several metabolic changes in AN5568 treated parasites resemble those invoked in cells treated with a strong reducing agent, dithiothreitol, suggesting redox imbalances could be involved in the killing mechanism.

Opinions des étudiants du diplôme d'études spécialisées complémentaires de médecine d'urgence au sujet du nouveau diplôme d'études spécialisées de médecine d'urgence

Introduction : La reconnaissance de la médecine d'urgence en France en tant que spécialité de plein exercice se concrétise par la mise en place de son diplôme d'études spécialisées (DES). Cette formation remplacera et rendra inaccessibles le diplôme d'études spécialisées complémentaires (DESC) de médecine d'urgence et capacité de médecine d'urgence ainsi que tous les autres DESC, et permettra la qualification ordinale comme urgentiste. Nous avons voulu connaître le ressenti des étudiants de l'actuel DESC de médecine d'urgence vis-à-vis de cette évolution.

Méthode : Nous avons interrogé les étudiants en cours de DESC de médecine d'urgence d'Île-de-France en mars 2017. Le critère de jugement principal était la proportion de ces derniers qui auraient fait le choix du DES de médecine d'urgence dès l'examen classant national (ECN) s'ils en avaient eu la possibilité. Secondairement, ils étaient interrogés sur leur souhait de s'inscrire à l'Ordre des médecins comme urgentistes et sur leur accord pour poursuivre le DESC dans l'hypothèse où celui-ci deviendrait qualifiant.

Résultats : Sur 253 étudiants interrogés, 95 réponses ont été reçues. Quarante-et-un pour cent affirment qu'ils auraient choisi le DES de médecine d'urgence dès l'ECN s'il avait été disponible. Trente-huit pour cent souhaitent s'inscrire à l'Ordre des médecins comme urgentistes. Si le DESC de médecine d'urgence devenait qualifiant, 39 % accepteraient de poursuivre cette formation. Le souhait de choisir le DES de médecine d'urgence s'il avait été disponible à l'ECN est fortement associé au souhait de poursuite du DESC s'il devenait qualifiant et à celui de s'inscrire à l'Ordre comme urgentiste.

Discussion : Ces résultats suggèrent que près de trois étudiants sur cinq actuellement en DESC n'auraient pas choisi le DES de médecine d'urgence. Les futurs étudiants du DES de médecine d'urgence auraient ainsi un profil différent des actuels DESC.

Descriptif de l'activité des structures des urgences en Île-de-France à l'aide du questionnaire « National Emergency Department Inventory » (NEDI) appliqué au système français

Introduction : La base de données NEDI (National Emergency Department Inventory) repose sur un descriptif de l'activité des structures des urgences (SU). Elle rend compte de la diversité de ces structures au niveau national et international. L'objectif de cette étude NEDI-Paris était de décrire l'organisation des SU en Île-de-France et les moyens à disposition, selon le statut public ou privé.

Méthode : Les SU ouvertes 24 heures/24 et 7 jours/7 ont été inclus. Un questionnaire comprenant 29 items a permis de recueillir les caractéristiques de ces services et les données relatives à l'activité de l'année 2015. Un taux de participation de 80 % était souhaité dans le cadre des enquêtes NEDI pour assurer une exhaustivité des résultats.

Résultats : Sur 117 services éligibles, 97 ont participé à l'étude, soit un taux de réponse de 83 %. L'ensemble de ces services était localisé dans des établissements hospitaliers. Le service était sur un seul site géographique dans 86 % des cas. Le nombre annuel médian de visites était de 34 000 (interquartile : 23 000–56 000). Soixante-six centres (68 %) appartenaient au système public, dont 22 centres universitaires et 31 centres (32 %) étaient des services privés. Les urgences adultes, pédiatriques et mixtes représentaient respectivement 54, 26 et 20 % de l'offre de soins. Un temps d'attente inférieur à une heure était rapporté par 25 % des services : 42 % pour les services privés versus 17 % dans le public (p = 0,01). Un taux d'hospitalisation inférieur à 20 % était rapporté par 54 % des centres, similaire entre public et privé (60 vs 50 % ; p = 0,40). Parmi les services interrogés, 22 % ont déclaré fonctionner en surcharge, plus fréquemment dans le public comparativement aux services privés (27 vs 10 %). La gestion 24 heures/24 et 7 jours/7 de certaines pathologies de même que la disponibilité de certains spécialistes étaient le plus souvent observées dans les hôpitaux publics, notamment universitaires.

Conclusion : L'enquête NEDI en Île-de-France a montré une hétérogénéité dans les caractéristiques et les moyens à disposition des SU. Un déterminant majeur de ces disparités repose sur le statut public versus privé. Une réflexion peut être menée à partir de ces résultats.

Effect of simulated patient death on emergency worker's anxiety: a cluster randomized trial

Objective

Simulation-based teaching offers promising and diverse teaching possibilities. We aim to assess whether the death of the manikin increased anxiety amongst learner compared to similar simulation-based course where the manikin stays alive.

Methods

We conducted a cluster randomized study amongst multidisciplinary teams of emergency workers. Teams of physicians, nurses, and healthcare assistants were randomly assigned to participate in a simulation-based course where the simulated patient died (death group) or not (life group). We assessed anxiety at 1 month after the teaching using Spielberger STAI-state anxiety questionnaire. We compared reduction of anxiety when facing a life-threatening situation in both groups.

Results

We included 25 teams for a total of 129 participants. We analysed 63 participants in the death group and 57 in the life group. Baseline characteristics were similar in both groups, including baseline anxiety (STAI-state score 39.6 (7.8) in the death group vs 38.6 (7.1) in the life group). We report a significant reduction in both groups 1 month after the training: 6.6 (7.8) vs 6 (8.0), mean difference 0.5 (−2.4; 3.4). At 3 months, we report a significant greater reduction of anxiety in the death group (mean difference 4 [0.1; 7.9]).

Conclusion

We observed in our sample that unexpected simulated patient death did not increase anxiety amongst multidisciplinary emergency workers.

AN2728, a new boron-based topical anti-inflammatory agent, inhibits phosphodiesterase 4 (IRC4P.611)

The novel boron-containing compound, AN2728, is being investigated in phase 3 trials for atopic dermatitis treatment. It exerts its anti-inflammatory effect by inhibiting phosphodiesterase-4 (PDE4), which catalyzes the breakdown of cAMP to AMP. AN2728 competes with cAMP to inhibit the PDE4B1-catalytic domain with Ki of 173±26 nM; thus AN2728 interacts at the enzyme-active site. The X-ray structure of PDE4B-catalytic domain with AN2728 and its structural relative AN2898 reveals that the boron atom interacts with the bimetal center and occupies a position in the catalytic site similar to that of the cAMP phosphate. AN2728 has good affinity across PDE4 gene products A-D. Its selective affinity for PDE4 is 4-10-fold greater than its affinity for PDE1, 2, 3A, 6, or 7B. It is inactive on PDE3B, 5, 7A1, and 8-11. AN2728 activity increases intracellular cAMP and activates PKA, followed by phosphorylation and negative regulation of various cytokine transcription factors. AN2728 inhibits production of specific cytokines with a pattern similar to that of other established PDE4 inhibitors and distinct from those of a glucocorticoid and calcineurin inhibitor. To investigate reactivity against other targets, AN2728 was tested against a set of 50 receptors and ligand-gated ion channels for inhibition at 10 µM. Inhibition was &lt;25% for all receptors; thus, AN2728 is specific for PDE4 and appears to exert an anti-inflammatory effect through inhibition of inflammatory cytokine production.

Linking phenotype to kinase: identification of a novel benzoxaborole hinge-binding motif for kinase inhibition and development of high-potency rho kinase inhibitors

Benzoxaboroles are a novel class of drug-like compounds that have been rich sources of novel inhibitors for various enzymes and of new drugs. While examining benzoxaborole activity in phenotypic screens, our attention was attracted by the (aminomethylphenoxy)benzoxaborole family, which potently inhibited Toll-like receptor-stimulated cytokine secretion from leukocytes. After considering their structure-activity relationships and the central role of kinases in leukocyte biology, we performed a kinome-wide screen to investigate the members of the (aminomethylphenoxy)benzoxaborole family. This technique identified Rho-activated kinase (ROCK) as a target. We showed competitive behavior, with respect to ATP, and then determined the ROCK2-drug cocrystal structure. The drug occupies the ATP site in which the oxaborole moiety provides hydrogen bond donors and acceptors to the hinge, and the aminomethyl group interacts with the magnesium/ATP-interacting aspartic acid common to protein kinases. The series exhibits excellent selectivity against most of the kinome, with greater than 15-fold selectivity against the next best member of the AGC protein kinase subfamily. Medicinal chemistry efforts with structure-based design resulted in a compound with a Ki of 170 nM. Cellular studies revealed strong enzyme inhibition rank correlation with suppression of intracellular phosphorylation of a ROCK substrate. The biochemical potencies of these compounds also translated to functional activity, causing smooth muscle relaxation in rat aorta and guinea pig trachea. The series exhibited oral availability and one member reduced rat blood pressure, consistent with ROCK's role in smooth muscle contraction. Thus, the benzoxaborole moiety represents a novel hinge-binding kinase scaffold that may have potential for therapeutic use.

SCYX-7158, an orally-active benzoxaborole for the treatment of stage 2 human African trypanosomiasis

Background

Human African trypanosomiasis (HAT) is an important public health problem in sub-Saharan Africa, affecting hundreds of thousands of individuals. An urgent need exists for the discovery and development of new, safe, and effective drugs to treat HAT, as existing therapies suffer from poor safety profiles, difficult treatment regimens, limited effectiveness, and a high cost of goods. We have discovered and optimized a novel class of small-molecule boron-containing compounds, benzoxaboroles, to identify SCYX-7158 as an effective, safe and orally active treatment for HAT.

Methodology/Principal Findings

A drug discovery project employing integrated biological screening, medicinal chemistry and pharmacokinetic characterization identified SCYX-7158 as an optimized analog, as it is active in vitro against relevant strains of Trypanosoma brucei, including T. b. rhodesiense and T. b. gambiense, is efficacious in both stage 1 and stage 2 murine HAT models and has physicochemical and in vitro absorption, distribution, metabolism, elimination and toxicology (ADMET) properties consistent with the compound being orally available, metabolically stable and CNS permeable. In a murine stage 2 study, SCYX-7158 is effective orally at doses as low as 12.5 mg/kg (QD×7 days). In vivo pharmacokinetic characterization of SCYX-7158 demonstrates that the compound is highly bioavailable in rodents and non-human primates, has low intravenous plasma clearance and has a 24-h elimination half-life and a volume of distribution that indicate good tissue distribution. Most importantly, in rodents brain exposure of SCYX-7158 is high, with C_max >10 µg/mL and AUC_{0–24 hr} >100 µg*h/mL following a 25 mg/kg oral dose. Furthermore, SCYX-7158 readily distributes into cerebrospinal fluid to achieve therapeutically relevant concentrations in this compartment.

Conclusions/Significance

The biological and pharmacokinetic properties of SCYX-7158 suggest that this compound will be efficacious and safe to treat stage 2 HAT. SCYX-7158 has been selected to enter preclinical studies, with expected progression to phase 1 clinical trials in 2011.

Human African trypanosomiasis (HAT) is caused by infection with the parasite Trypanosoma brucei and is an important public health problem in sub-Saharan Africa. New, safe, and effective drugs are urgently needed to treat HAT, particularly stage 2 disease where the parasite infects the brain. Existing therapies for HAT have poor safety profiles, difficult treatment regimens, limited effectiveness, and a high cost of goods. Through an integrated drug discovery project, we have discovered and optimized a novel class of boron-containing small molecules, benzoxaboroles, to deliver SCYX-7158, an orally active preclinical drug candidate. SCYX-7158 cured mice infected with T. brucei, both in the blood and in the brain. Extensive pharmacokinetic characterization of SCYX-7158 in rodents and non-human primates supports the potential of this drug candidate for progression to IND-enabling studies in advance of clinical trials for stage 2 HAT.

Discovery of novel benzoxaborole-based potent antitrypanosomal agents

We report the discovery of benzoxaborole antitrypanosomal agents and their structure-activity relationships on central linkage groups and different substitution patterns in the sulfur-linked series. The compounds showed in vitro growth inhibition IC50 values as low as 0.02 μg/mL and in vivo efficacy in acute murine infection models against Tryapnosoma brucei.