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Feitosa NM, da Costa Rodrigues B, Petry AC, Nocchi KJCV, de Moraes Brindeiro R, Zilberberg C, Monteiro-de-Barros C, Mury FB, de Souza-Menezes J, Nepomuceno-Silva JL, da Silva ML, de Medeiros MJ, de Souza Gestinari R, da Silva de Alvarenga A, Pozzobon APB, Silva CAO, das Graças Dos Santos D, Silvestre DH, de Sousa GF, de Almeida JF, da Silva JN, Brandão LM, de Oliveira Drummond L, Neto LRG, de Mello Carpes R, Dos Santos RC, Portal TM, Tanuri A, Nunes-da-Fonseca R. Molecular testing and analysis of disease spreading during the emergence of COVID-19 in Macaé, the Brazilian National Capital of Oil. Sci Rep 2021; 11:20121. [PMID: 34635707 PMCID: PMC8505656 DOI: 10.1038/s41598-021-99475-7] [Citation(s) in RCA: 2] [Impact Index Per Article: 0.7] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Grants] [Track Full Text] [Download PDF] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 03/12/2021] [Accepted: 09/21/2021] [Indexed: 01/12/2023] Open
Abstract
The Brazilian strategy to overcome the spread of COVID-19 has been particularly criticized due to the lack of a national coordinating effort and an appropriate testing program. Here, a successful approach to control the spread of COVID-19 transmission is described by the engagement of public (university and governance) and private sectors (hospitals and oil companies) in Macaé, state of Rio de Janeiro, Brazil, a city known as the National Oil Capital. In 2020 between the 17th and 38th epidemiological week, over two percent of the 206,728 citizens were subjected to symptom analysis and RT-qPCR testing by the Federal University of Rio de Janeiro, with positive individuals being notified up to 48 h after swab collection. Geocodification and spatial cluster analysis were used to limit COVID-19 spreading in Macaé. Within the first semester after the outbreak of COVID-19 in Brazil, Macaé recorded 1.8% of fatalities associated with COVID-19 up to the 38th epidemiological week, which was at least five times lower than the state capital (10.6%). Overall, considering the successful experience of this joint effort of private and public engagement in Macaé, our data suggest that the development of a similar strategy countrywise could have contributed to a better control of the COVID-19 spread in Brazil. Quarantine decree by the local administration, comprehensive molecular testing coupled to scientific analysis of COVID-19 spreading, prevented the catastrophic consequences of the pandemic as seen in other populous cities within the state of Rio de Janeiro and elsewhere in Brazil.
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Affiliation(s)
- Natália Martins Feitosa
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Bruno da Costa Rodrigues
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Ana Cristina Petry
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Keity Jaqueline Chagas Vilela Nocchi
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Rodrigo de Moraes Brindeiro
- Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Rio de Janeiro, 21941-902, Brazil
| | - Carla Zilberberg
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Cintia Monteiro-de-Barros
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Flavia Borges Mury
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Jackson de Souza-Menezes
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - José Luciano Nepomuceno-Silva
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Manuela Leal da Silva
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Marcio José de Medeiros
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Raquel de Souza Gestinari
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Alessandra da Silva de Alvarenga
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Allan Pierre Bonetti Pozzobon
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Carina Azevedo Oliveira Silva
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Daniele das Graças Dos Santos
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Diego Henrique Silvestre
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Graziele Fonseca de Sousa
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Janimayri Forastieri de Almeida
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Jhenifer Nascimento da Silva
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Layza Mendes Brandão
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Leandro de Oliveira Drummond
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Lupis Ribeiro Gomes Neto
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Raphael de Mello Carpes
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Renata Coutinho Dos Santos
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Taynan Motta Portal
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil
| | - Amilcar Tanuri
- Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Rio de Janeiro, 21941-902, Brazil.
| | - Rodrigo Nunes-da-Fonseca
- Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil.
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