Conan Y, Herbert J, Salpetrier C, Godillon L, Fourquet F, Dhalluin T, Laurent E, Grammatico-Guillon L. Les entrepôts de données cliniques : un outil d’aide au pilotage de crise.
Infect Dis Now 2021. [PMCID:
PMC8327571 DOI:
10.1016/j.idnow.2021.06.119]
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Abstract
Introduction
La crise sanitaire COVID-19 a nécessité la mise en place d’un suivi épidémique quotidien (épidémiologie et activité) en établissements de santé pour adapter, en situation d’incertitude, la gestion hospitalière (capacités comme ressources humaines). Le département de santé publique du CHU a créé et automatisé un tableau de bord (TdB) de suivi COVID en temps réel en utilisant son entrepôt de données cliniques.
Matériels et méthodes
Dès mars 2020, l’équipe d’épidémiologie et de santé publique, en collaboration avec la cellule de crise du CHU constituée de soignants, virologues et directeurs, a construit des indicateurs de suivi épidémique consultables dans un TdB interactif. Les données utilisées sont issues de l’entrepôt eHOP® implémenté au CHU qui intègre en temps réel les données du dossier patient informatisé : comptes rendus médicaux, biologie, prescriptions. Ces indicateurs sont automatisés et mis à jour toutes les 6 heures sur l’intranet du CHU (Dashboard R Shiny®), accessible en temps réel pour tous les agents. En parallèle, des données d’open data départementales et régionales (data.gouv.fr : hospitalisation SI-VIC, dépistage SI-DEP, vaccination SI-VAC) ont été intégrées au TdB.
Résultats
Sont consultables à tout moment via des graphiques interactifs : l’évolution des hospitalisations COVID au sein des différents secteurs (médecine dont secteur COVID ou non, réanimation, autres) ; les caractéristiques des patients hospitalisés, guéris et/ou décédés ; les passages aux urgences pour suspicion COVID, dont les cas confirmés et ceux ayant nécessité une hospitalisation ; le nombre et le taux de positivité des tests de dépistage (RT-PCR, TAG) et des sérologies réalisés par le laboratoire de virologie, que ce soit pour des personnes du CHU ou du GHT élargi. Les données de couverture vaccinale des agents du CHU par professions, ainsi que le nombre de vaccinations effectuées pour des personnes hors CHU (patients, professionnels libéraux) y sont implémentées depuis janvier 2021. Au niveau départemental et régional sont consultables : l’évolution des incidences, par âge et départements, et des hospitalisations COVID du département et de la région (dont mortalité et tension en réanimation), ainsi que des cartographies hebdomadaires sur l’activité de dépistage (taux de dépistage, de positivité, d’incidence) et hospitalière.
Conclusion
Le développement d’un TdB automatisé permet une aide à la décision de la cellule de crise du CHU par la mise à disposition en temps réel de données objectives et donc une gestion réactive et agile. L’information continue des agents favorise la transmission d’informations et de messages clés, comme la promotion de la vaccination.
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