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Heide S, Argilli E, Valence S, Boutaud L, Roux N, Mignot C, Nava C, Keren B, Giraudat K, Faudet A, Gerasimenko A, Garel C, Blondiaux E, Rastetter A, Grevent D, Le C, Mackenzie L, Richards L, Attié-Bitach T, Depienne C, Sherr E, Héron D. Loss-of-function variants in ZEB1 cause dominant anomalies of the corpus callosum with favourable cognitive prognosis. J Med Genet 2024; 61:244-249. [PMID: 37857482 DOI: 10.1136/jmg-2023-109293] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 03/23/2023] [Accepted: 09/17/2023] [Indexed: 10/21/2023]
Abstract
BACKGROUND The neurodevelopmental prognosis of anomalies of the corpus callosum (ACC), one of the most frequent brain malformations, varies extremely, ranging from normal development to profound intellectual disability (ID). Numerous genes are known to cause syndromic ACC with ID, whereas the genetics of ACC without ID remains poorly deciphered. METHODS Through a collaborative work, we describe here ZEB1, a gene previously involved in an ophthalmological condition called type 3 posterior polymorphous corneal dystrophy, as a new dominant gene of ACC. We report a series of nine individuals with ACC (including three fetuses terminated due to ACC) carrying a ZEB1 heterozygous loss-of-function (LoF) variant, identified by exome sequencing. RESULTS In five cases, the variant was inherited from a parent with a normal corpus callosum, which illustrates the incomplete penetrance of ACC in individuals with an LoF in ZEB1. All patients reported normal schooling and none of them had ID. Neuropsychological assessment in six patients showed either normal functioning or heterogeneous cognition. Moreover, two patients had a bicornuate uterus, three had a cardiovascular anomaly and four had macrocephaly at birth, which suggests a larger spectrum of malformations related to ZEB1. CONCLUSION This study shows ZEB1 LoF variants cause dominantly inherited ACC without ID and extends the extraocular phenotype related to this gene.
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Affiliation(s)
- Solveig Heide
- Department of Genetics and Referral Center for Intellectual disabilities of rare causes, AP-HP.Sorbonne Université, Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, 75013, France, Paris, France
| | - Emanuela Argilli
- Department of Neurology, University of California San Francisco Division of Hospital Medicine, San Francisco, California, USA
- Institute of Human Genetics and Weill Institute for Neurosciences, University of California, San Francisco, California, USA
| | - Stéphanie Valence
- Department of Neuropediatry & Referral Center for Intellectual disabilities of rare causes, AP-HP.Sorbonne Université, Hopital Armand-Trousseau, Paris, France
| | - Lucile Boutaud
- Genomic medicine of rare diseases, UF MP5, Hopital universitaire Necker-enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Nathalie Roux
- Genomic medicine of rare diseases, UF MP5, Hopital universitaire Necker-enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Cyril Mignot
- Department of Genetics and Referral Center for Intellectual disabilities of rare causes, AP-HP.Sorbonne Université, Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, 75013, France, Paris, France
| | - Caroline Nava
- Department of Genetics, Unit of Developmental Genomics, AP-HP.Sorbonne Université, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, France
| | - Boris Keren
- Department of Genetics, Unit of Developmental Genomics, AP-HP.Sorbonne Université, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, France
| | - Kim Giraudat
- Department of Neuropediatry & Referral Center for Intellectual disabilities of rare causes, AP-HP.Sorbonne Université, Hopital Armand-Trousseau, Paris, France
| | - Anne Faudet
- Department of Genetics and Referral Center for Intellectual disabilities of rare causes, AP-HP.Sorbonne Université, Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, 75013, France, Paris, France
| | - Anna Gerasimenko
- Department of Genetics and Referral Center for Intellectual disabilities of rare causes, AP-HP.Sorbonne Université, Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, 75013, France, Paris, France
| | - Catherine Garel
- Department of pediatric and prenatal imaging, Armand-Trousseau Hospital, Sorbonne Université, Assistance Publique des Hôpitaux de Paris (AP-HP), Paris, France
| | - Eleonore Blondiaux
- Department of pediatric and prenatal imaging, Armand-Trousseau Hospital, Sorbonne Université, Assistance Publique des Hôpitaux de Paris (AP-HP), Paris, France
| | - Agnès Rastetter
- Paris Brain Institute (ICM Institut du Cerveau), Sorbonne Université, INSERM UMR S 1127, Paris, France
| | - David Grevent
- Radiology Department, Hopital universitaire Necker-enfants Malades, Paris, France
- EA fetus 7328 and LUMIERE Platform, Université de Paris, Paris, France
| | - Carolyn Le
- Institute of Human Genetics and Weill Institute for Neurosciences, University of California, San Francisco, California, USA
- Department of Neurology, University of California, Institute of Human Genetics and Weill Institute for Neurosciences, San Francisco, California, USA
| | - Lisa Mackenzie
- Department of Neuroscience, Washington University in St Louis School of Medicine, St Louis, Missouri, USA
| | - Linda Richards
- Department of Neuroscience, Washington University in St Louis School of Medicine, St Louis, Missouri, USA
- Queensland Brain Institute, University of Queensland, Brisbane, Queensland, Australia
| | - Tania Attié-Bitach
- Genomic medicine of rare diseases, UF MP5, Hopital universitaire Necker-enfants Malades, Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Paris, France
| | - Christel Depienne
- Institute of Human Genetics, University Hospital Essen, Universitu Duisburg-Essen, Essen, Germany
| | - Elliott Sherr
- Department of Neurology, University of California San Francisco Division of Hospital Medicine, San Francisco, California, USA
- Institute of Human Genetics and Weill Institute for Neurosciences, University of California, San Francisco, California, USA
| | - Delphine Héron
- Department of Genetics and Referral Center for Intellectual disabilities of rare causes, AP-HP.Sorbonne Université, Assistance Publique-Hopitaux de Paris, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, 75013, France, Paris, France
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Colin E, Duffourd Y, Tisserant E, Relator R, Bruel AL, Tran Mau-Them F, Denommé-Pichon AS, Safraou H, Delanne J, Jean-Marçais N, Keren B, Isidor B, Vincent M, Mignot C, Heron D, Afenjar A, Heide S, Faudet A, Charles P, Odent S, Herenger Y, Sorlin A, Moutton S, Kerkhof J, McConkey H, Chevarin M, Poë C, Couturier V, Bourgeois V, Callier P, Boland A, Olaso R, Philippe C, Sadikovic B, Thauvin-Robinet C, Faivre L, Deleuze JF, Vitobello A. OMIXCARE: OMICS technologies solved about 33% of the patients with heterogeneous rare neuro-developmental disorders and negative exome sequencing results and identified 13% additional candidate variants. Front Cell Dev Biol 2022; 10:1021785. [PMID: 36393831 PMCID: PMC9650323 DOI: 10.3389/fcell.2022.1021785] [Citation(s) in RCA: 5] [Impact Index Per Article: 2.5] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 08/17/2022] [Accepted: 10/11/2022] [Indexed: 07/28/2023] Open
Abstract
Purpose: Patients with rare or ultra-rare genetic diseases, which affect 350 million people worldwide, may experience a diagnostic odyssey. High-throughput sequencing leads to an etiological diagnosis in up to 50% of individuals with heterogeneous neurodevelopmental or malformation disorders. There is a growing interest in additional omics technologies in translational research settings to examine the remaining unsolved cases. Methods: We gathered 30 individuals with malformation syndromes and/or severe neurodevelopmental disorders with negative trio exome sequencing and array comparative genomic hybridization results through a multicenter project. We applied short-read genome sequencing, total RNA sequencing, and DNA methylation analysis, in that order, as complementary translational research tools for a molecular diagnosis. Results: The cohort was mainly composed of pediatric individuals with a median age of 13.7 years (4 years and 6 months to 35 years and 1 month). Genome sequencing alone identified at least one variant with a high level of evidence of pathogenicity in 8/30 individuals (26.7%) and at least a candidate disease-causing variant in 7/30 other individuals (23.3%). RNA-seq data in 23 individuals allowed two additional individuals (8.7%) to be diagnosed, confirming the implication of two pathogenic variants (8.7%), and excluding one candidate variant (4.3%). Finally, DNA methylation analysis confirmed one diagnosis identified by genome sequencing (Kabuki syndrome) and identified an episignature compatible with a BAFopathy in a patient with a clinical diagnosis of Coffin-Siris with negative genome and RNA-seq results in blood. Conclusion: Overall, our integrated genome, transcriptome, and DNA methylation analysis solved 10/30 (33.3%) cases and identified a strong candidate gene in 4/30 (13.3%) of the patients with rare neurodevelopmental disorders and negative exome sequencing results.
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Affiliation(s)
- Estelle Colin
- Service de Génétique Médicale, CHU d’Angers, Angers, France
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
| | - Yannis Duffourd
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Emilie Tisserant
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
| | - Raissa Relator
- Molecular Diagnostics Program and Verspeeten Clinical Genome Centre, London Health Sciences and Saint Joseph’s Healthcare, London, ON, Canada
| | - Ange-Line Bruel
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Frédéric Tran Mau-Them
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Anne-Sophie Denommé-Pichon
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Hana Safraou
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Julian Delanne
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Centre de Génétique et Centre de Référence “Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs”, Hôpital d’Enfants, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon, Dijon, France
| | - Nolwenn Jean-Marçais
- Centre de Génétique et Centre de Référence “Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs”, Hôpital d’Enfants, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon, Dijon, France
| | - Boris Keren
- Assistance publique - Hôpitaux de Paris (APHP), Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié Salpêtrière, Paris, France
| | | | - Marie Vincent
- Service de Génétique Médicale, CHU Nantes, Nantes, France
| | - Cyril Mignot
- Sorbonne Université/INSERM U1127/CNRS UMR 7225/Institut du Cerveau, Paris, France
- Service de Neurologie, Hôpital la Pitié Salpêtrière, Sorbonne Université, Paris, France
| | - Delphine Heron
- Département de Génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris Sorbonne Université, Hôpital Pitié-Salpêtrière et Trousseau, Paris, France
| | - Alexandra Afenjar
- Assistance publique - Hôpitaux de Paris, Département de Génétique, Sorbonne Université, GRC No. 19, ConCer-LD, Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France
| | - Solveig Heide
- Département de Génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris Sorbonne Université, Hôpital Pitié-Salpêtrière et Trousseau, Paris, France
| | - Anne Faudet
- Département de Génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris Sorbonne Université, Hôpital Pitié-Salpêtrière et Trousseau, Paris, France
| | - Perrine Charles
- Département de Génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris Sorbonne Université, Hôpital Pitié-Salpêtrière et Trousseau, Paris, France
| | - Sylvie Odent
- Service de Génétique Clinique, European Reference Network (ERN) ITHACA, CHU Rennes, Rennes, France
- IGDR (Institut de Génétique et Développement de Rennes)—UMR 6290, ERL U1305, CNRS, INSERM, Univ Rennes, Rennes, France
| | - Yvan Herenger
- Service de Génétique Médicale, CHU de Tours, Tours, France
| | - Arthur Sorlin
- Centre de Génétique et Centre de Référence “Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs”, Hôpital d’Enfants, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon, Dijon, France
| | - Sébastien Moutton
- Centre de Génétique et Centre de Référence “Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs”, Hôpital d’Enfants, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon, Dijon, France
| | - Jennifer Kerkhof
- Molecular Diagnostics Program and Verspeeten Clinical Genome Centre, London Health Sciences and Saint Joseph’s Healthcare, London, ON, Canada
| | - Haley McConkey
- Molecular Diagnostics Program and Verspeeten Clinical Genome Centre, London Health Sciences and Saint Joseph’s Healthcare, London, ON, Canada
| | - Martin Chevarin
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Charlotte Poë
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Victor Couturier
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Valentin Bourgeois
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Patrick Callier
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
| | - Anne Boland
- Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), Université Paris-Saclay, Evry, France
| | - Robert Olaso
- Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), Université Paris-Saclay, Evry, France
- LabEx GENMED (Medical Genomics)ParisFrance
| | - Christophe Philippe
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Bekim Sadikovic
- Molecular Diagnostics Program and Verspeeten Clinical Genome Centre, London Health Sciences and Saint Joseph’s Healthcare, London, ON, Canada
- Department of Pathology and Laboratory Medicine, Western University, London, ON, Canada
| | - Christel Thauvin-Robinet
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
- Centre de Référence Maladies Rares “Déficiences Intellectuelles de Causes Rares”, Centre de Génétique, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
| | - Laurence Faivre
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Centre de Génétique et Centre de Référence “Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs”, Hôpital d’Enfants, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon, Dijon, France
| | - Jean-François Deleuze
- Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), Université Paris-Saclay, Evry, France
- LabEx GENMED (Medical Genomics)ParisFrance
| | - Antonio Vitobello
- UFR des Sciences de Santé, GAD “Génétique des Anomalies du Développement”, INSERM-Université de Bourgogne UMR1231, Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU)-TRANSLAD, Dijon, France
- Unité Fonctionnelle Innovation en Diagnostic Génomique des Maladies Rares, Fédération Hospitalo-Universitaire-TRANSLAD, CHU Dijon Bourgogne, Dijon, France
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Vibert R, Mignot C, Keren B, Chantot-Bastaraud S, Portnoï MF, Nouguès MC, Moutard ML, Faudet A, Whalen S, Haye D, Garel C, Chatron N, Rossi M, Vincent-Delorme C, Boute O, Delobel B, Andrieux J, Devillard F, Coutton C, Puechberty J, Pebrel-Richard C, Colson C, Gerard M, Missirian C, Sigaudy S, Busa T, Doco-Fenzy M, Malan V, Rio M, Doray B, Sanlaville D, Siffroi JP, Héron D, Heide S. Neurodevelopmental phenotype in 36 new patients with 8p inverted duplication-deletion: Genotype-phenotype correlation for anomalies of the corpus callosum. Clin Genet 2021; 101:307-316. [PMID: 34866188 DOI: 10.1111/cge.14096] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 10/06/2021] [Revised: 11/26/2021] [Accepted: 12/02/2021] [Indexed: 11/26/2022]
Abstract
Inverted duplication deletion 8p [invdupdel(8p)] is a complex and rare chromosomal rearrangement that combines a distal deletion and an inverted interstitial duplication of the short arm of chromosome 8. Carrier patients usually have developmental delay and intellectual disability (ID), associated with various cerebral and extra-cerebral malformations. Invdupdel(8p) is the most common recurrent chromosomal rearrangement in ID patients with anomalies of the corpus callosum (AnCC). Only a minority of invdupdel(8p) cases reported in the literature to date had both brain cerebral imaging and chromosomal microarray (CMA) with precise breakpoints of the rearrangements, making genotype-phenotype correlation studies for AnCC difficult. In this study, we report the clinical, radiological, and molecular data from 36 new invdupdel(8p) cases including three fetuses and five individuals from the same family, with breakpoints characterized by CMA. Among those, 97% (n = 32/33) of patients presented with mild to severe developmental delay/ID and 34% had seizures with mean age of onset of 3.9 years (2 months-9 years). Moreover, out of the 24 patients with brain MRI and 3 fetuses with neuropathology analysis, 63% (n = 17/27) had AnCC. We review additional data from 99 previously published patients with invdupdel(8p) and compare data of 17 patients from the literature with both CMA analysis and brain imaging to refine genotype-phenotype correlations for AnCC. This led us to refine a region of 5.1 Mb common to duplications of patients with AnCC and discuss potential candidate genes within this region.
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Affiliation(s)
- Roseline Vibert
- Département de Génétique, Hôpital Armand-Trousseau and Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Cyril Mignot
- Département de Génétique, Hôpital Armand-Trousseau and Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Boris Keren
- UF de Génomique du Développement, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | | | - Marie-France Portnoï
- Department of Cytogenetics, Armand Trousseau Hospital, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Marie-Christine Nouguès
- Service of Pediatric Neurology, Armand Trousseau Hospital, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Marie-Laure Moutard
- Service of Pediatric Neurology, Armand Trousseau Hospital, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Anne Faudet
- Département de Génétique, Hôpital Armand-Trousseau and Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Sandra Whalen
- UF de Génétique Clinique et Centre de Référence Maladies Rares des Anomalies du Développement et Syndromes Malformatifs, Hôpital Armand Trousseau, ERN ITHACA, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Damien Haye
- Département de Génétique, Hôpital Armand-Trousseau and Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Catherine Garel
- Department of Radiology, Armand Trousseau Hospital, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Nicolas Chatron
- Departments of Genetics, Lyon University Hospitals, Lyon, France
| | - Massimiliano Rossi
- Genetics Department, Referral Centre for Developmental Abnormalities, Lyon University Hospital, and INSERM U1028, CNRS UMR5292, Lyon Neuroscience Research Centre, GENDEV Team, Claude Bernard Lyon 1 University, Bron, France
| | | | - Odile Boute
- Service of Clinical Genetic, Jeanne de Flandre Hospital, Lille, France
| | - Bruno Delobel
- Service of Cytogenetics, Institut Catholique de Lille, Lille, France
| | - Joris Andrieux
- Institute of Medical Genetics, Jeanne de Flandre Hospital, Lille, France
| | - Françoise Devillard
- Service de Génétique, Génomique, et Procréation, Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes, 38700 La Tronche, France; INSERM 1209, CNRS UMR 5309, Institute for Advanced Biosciences, Université Grenoble Alpes, Grenoble, France
| | - Charles Coutton
- Service de Génétique, Génomique, et Procréation, Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes, 38700 La Tronche, France; INSERM 1209, CNRS UMR 5309, Institute for Advanced Biosciences, Université Grenoble Alpes, Grenoble, France
| | - Jacques Puechberty
- Department of Medical Genetics, Arnaud de Villeneuve Hospital, Montpellier, France
| | - Céline Pebrel-Richard
- Service of Cytogenetic, Clermont-Ferrand's University Hospital, Clermont-Ferrand, France
| | - Cindy Colson
- Service of Clinical Genetic, Caen's University Hospital, Caen, France
| | - Marion Gerard
- Service of Clinical Genetic, Caen's University Hospital, Caen, France
| | - Chantal Missirian
- APHM, Laboratory of Genetic, Timone Enfants' Hospital, Marseille, France
| | - Sabine Sigaudy
- Department of Medical Genetics, Timone Enfants' Hospital, Marseille, France
| | - Tiffany Busa
- Department of Medical Genetics, Timone Enfants' Hospital, Marseille, France
| | | | - Valérie Malan
- APHP, Service de Médecine Génomique, Hôpital Necker-Enfants Malades, Paris, Université de Paris, Paris, France
| | - Marlène Rio
- Department of Genetics, Hôpital Necker-Enfants Malades, AP-HP, Paris, France
| | - Bérénice Doray
- Service of Genetic, Felix Guyon Hospital, La Réunion, France
| | | | - Jean-Pierre Siffroi
- Department of Cytogenetics, Armand Trousseau Hospital, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Delphine Héron
- Département de Génétique, Hôpital Armand-Trousseau and Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
| | - Solveig Heide
- Département de Génétique, Hôpital Armand-Trousseau and Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, APHP-Sorbonne Université, Paris, France
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Heide S, Spentchian M, Valence S, Buratti J, Mach C, Lejeune E, Olin V, Massimello M, Lehalle D, Mouthon L, Whalen S, Faudet A, Mignot C, Garel C, Blondiaux E, Lefebvre M, Quenum-Miraillet G, Chantot-Bastaraud S, Milh M, Bretelle F, Portes VD, Guibaud L, Putoux A, Tsatsaris V, Spodenkiewic M, Layet V, Dard R, Mandelbrot L, Guet A, Moutton S, Gorce M, Nizon M, Vincent M, Beneteau C, Rocchisanni MA, Benachi A, Saada J, Attié-Bitach T, Guilbaud L, Maurice P, Friszer S, Jouannic JM, de Villemeur TB, Moutard ML, Keren B, Héron D. Prenatal exome sequencing in 65 fetuses with abnormality of the corpus callosum: contribution to further diagnostic delineation. Genet Med 2020; 22:1887-1891. [PMID: 32565546 DOI: 10.1038/s41436-020-0872-8] [Citation(s) in RCA: 15] [Impact Index Per Article: 3.8] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 01/11/2020] [Revised: 05/26/2020] [Accepted: 06/07/2020] [Indexed: 11/09/2022] Open
Abstract
PURPOSE Abnormality of the corpus callosum (AbnCC) is etiologically a heterogeneous condition and the prognosis in prenatally diagnosed cases is difficult to predict. The purpose of our research was to establish the diagnostic yield using chromosomal microarray (CMA) and exome sequencing (ES) in cases with prenatally diagnosed isolated (iAbnCC) and nonisolated AbnCC (niAbnCC). METHODS CMA and prenatal trio ES (pES) were done on 65 fetuses with iAbnCC and niAbnCC. Only pathogenic gene variants known to be associated with AbnCC and/or intellectual disability were considered. RESULTS pES results were available within a median of 21.5 days (9-53 days). A pathogenic single-nucleotide variant (SNV) was identified in 12 cases (18%) and a pathogenic CNV was identified in 3 cases (4.5%). Thus, the genetic etiology was determined in 23% of cases. In all diagnosed cases, the results provided sufficient information regarding the neurodevelopmental prognosis and helped the parents to make an informed decision regarding the outcome of the pregnancy. CONCLUSION Our results show the significant diagnostic and prognostic contribution of CMA and pES in cases with prenatally diagnosed AbnCC. Further prospective cohort studies with long-term follow-up of the born children will be needed to provide accurate prenatal counseling after a negative pES result.
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Affiliation(s)
- Solveig Heide
- UF de Génétique Médicale et CRMR « Déficience intellectuelle », Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France.
| | - Myrtille Spentchian
- UF de Génétique Médicale et CRMR « Déficience intellectuelle », Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Stéphanie Valence
- Service de Neurologie Pédiatrique, Hôpital Armand Trousseau, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Julien Buratti
- UF de Génomique du Développement, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Corinne Mach
- UF de Génomique du Développement, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Elodie Lejeune
- UF de Génomique du Développement, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Valérie Olin
- UF de Génomique du Développement, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Marta Massimello
- UF de Génétique Médicale et CRMR « Déficience intellectuelle », Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Daphné Lehalle
- UF de Génétique Médicale et CRMR « Déficience intellectuelle », Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Linda Mouthon
- UF de Génétique Médicale et CRMR « Déficience intellectuelle », Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Sandra Whalen
- Service de Génétique Clinique, Hôpital Armand Trousseau, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Anne Faudet
- UF de Génétique Médicale et CRMR « Déficience intellectuelle », Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Cyril Mignot
- UF de Génétique Médicale et CRMR « Déficience intellectuelle », Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Catherine Garel
- Service de Radiologie Pédiatrique, Hôpital Armand Trousseau, HUEP, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Eleonore Blondiaux
- Service de Radiologie Pédiatrique, Hôpital Armand Trousseau, HUEP, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Mathilde Lefebvre
- Service de Foetopathologie, Hôpital Armand Trousseau, HUEP, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | | | - Sandra Chantot-Bastaraud
- Service de Cytogénétique, Hôpital Armand Trousseau, HUEP, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Mathieu Milh
- Service de Neurologie Pédiatrique, Hôpital La Timone, APHM, Marseille, France
| | - Florence Bretelle
- Service de Gynécologie Obstétrique, Hôpital Nord, APHM, Aix-Marseille Université, Marseille, France
| | - Vincent des Portes
- Service de Neurologie Pédiatrique, Hospices Civils de Lyon, Bron, France
| | - Laurent Guibaud
- Service de Radiologie Pédiatrique, Hospices Civils de Lyon, Bron, France
| | - Audrey Putoux
- Service de Génétique Clinique, Hospices Civils de Lyon, Bron, France
| | | | | | - Valérie Layet
- Service de Génétique Clinique, Hôpital du Havre, Le Havre, France
| | - Rodolphe Dard
- Service de Génétique Clinique, Hôpital de Poissy, Poissy, France
| | - Laurent Mandelbrot
- Service de Gynécologie Obstétrique, APHP, Université de Paris, Hôpital Louis Mourier, Colombes, France
| | - Agnès Guet
- Service de Pédiatrie, APHP, Hôpital Louis Mourier, Colombes, France
| | | | - Magali Gorce
- Service de Génétique Clinique, CHU d'Angers, Angers, France
| | - Mathilde Nizon
- Service de Génétique Clinique, CHU de Nantes, Nantes, France
| | - Marie Vincent
- Service de Génétique Clinique, CHU de Nantes, Nantes, France
| | - Claire Beneteau
- Service de Génétique Clinique, CHU de Nantes, Nantes, France
| | | | - Alexandra Benachi
- Service de Gynécologie-Obstétrique, Hôpital Antoine Béclère, APHP, Université Paris Saclay, Clamart, France
| | - Julien Saada
- Service de Gynécologie-Obstétrique, Hôpital Antoine Béclère, APHP, Université Paris Saclay, Clamart, France
| | - Tania Attié-Bitach
- Embryofoetopathologie, Service Histologie-Embryologie-Cytogénétique, Hôpital Necker-Enfants Malades, APHP, Paris, France
| | - Lucie Guilbaud
- Fetal Medicine Département, Hôpital Armand Trousseau, APHP, Sorbonne Université, Paris, France
| | - Paul Maurice
- Fetal Medicine Département, Hôpital Armand Trousseau, APHP, Sorbonne Université, Paris, France
| | - Stéphanie Friszer
- Fetal Medicine Département, Hôpital Armand Trousseau, APHP, Sorbonne Université, Paris, France
| | - Jean-Marie Jouannic
- Fetal Medicine Département, Hôpital Armand Trousseau, APHP, Sorbonne Université, Paris, France
| | | | - Marie-Laure Moutard
- Service de Neurologie Pédiatrique, Hôpital Armand Trousseau, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Boris Keren
- UF de Génomique du Développement, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
| | - Delphine Héron
- UF de Génétique Médicale et CRMR « Déficience intellectuelle », Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France
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5
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Moutton S, Bruel AL, Assoum M, Chevarin M, Sarrazin E, Goizet C, Guerrot AM, Charollais A, Charles P, Heron D, Faudet A, Houcinat N, Vitobello A, Tran-Mau-Them F, Philippe C, Duffourd Y, Thauvin-Robinet C, Faivre L. Truncating variants of the DLG4
gene are responsible for intellectual disability with marfanoid features. Clin Genet 2018; 93:1172-1178. [DOI: 10.1111/cge.13243] [Citation(s) in RCA: 12] [Impact Index Per Article: 2.0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 12/11/2017] [Revised: 02/06/2018] [Accepted: 02/15/2018] [Indexed: 02/02/2023]
Affiliation(s)
- S. Moutton
- Reference Center for Developmental Anomalies, Department of Medical Genetics; Dijon University Hospital; Dijon France
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - A.-L. Bruel
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - M. Assoum
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - M. Chevarin
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - E. Sarrazin
- Caribbean Reference Center for Rare Neurological and Neuromuscular Diseases; Fort de France University Hospital; Fort de France France
| | - C. Goizet
- Reference Center for Developmental Anomalies, Medical Genetics Department, CHU Bordeaux and Laboratoire MRGM, INSERM U1211; University of Bordeaux; Bordeaux France
| | - A.-M. Guerrot
- Department of Genetics; Rouen University Hospital; Rouen France
| | - A. Charollais
- Department of Neonatal Medicine and Intensive Care, Neuropediatrics and Reference Centre for Learning Disabilities; Rouen University Hospital; Rouen France
| | - P. Charles
- Reference Center for Rare Intellectual Disability Disorders, AP-HP, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, France and Clinical Research Group “intellectual disability and autism”; UPMC; Paris France
| | - D. Heron
- Reference Center for Rare Intellectual Disability Disorders, AP-HP, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, France and Clinical Research Group “intellectual disability and autism”; UPMC; Paris France
| | - A. Faudet
- Reference Center for Rare Intellectual Disability Disorders, AP-HP, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris, France and Clinical Research Group “intellectual disability and autism”; UPMC; Paris France
| | - N. Houcinat
- Reference Center for Developmental Anomalies, Department of Medical Genetics; Dijon University Hospital; Dijon France
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - A. Vitobello
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - F. Tran-Mau-Them
- Reference Center for Developmental Anomalies, Department of Medical Genetics; Dijon University Hospital; Dijon France
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - C. Philippe
- Reference Center for Developmental Anomalies, Department of Medical Genetics; Dijon University Hospital; Dijon France
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - Y. Duffourd
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - C. Thauvin-Robinet
- Reference Center for Developmental Anomalies, Department of Medical Genetics; Dijon University Hospital; Dijon France
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
| | - L. Faivre
- Reference Center for Developmental Anomalies, Department of Medical Genetics; Dijon University Hospital; Dijon France
- INSERM U1231, LNC UMR1231 GAD; Burgundy University; Dijon France
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6
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Mignot C, Moutard ML, Rastetter A, Boutaud L, Heide S, Billette T, Doummar D, Garel C, Afenjar A, Jacquette A, Lacombe D, Verloes A, Bole-Feysot C, Nitschké P, Masson C, Faudet A, Lesne F, Bienvenu T, Alby C, Attié-Bitach T, Depienne C, Nava C, Héron D. ARID1B mutations are the major genetic cause of corpus callosum anomalies in patients with intellectual disability. Brain 2018; 139:e64. [PMID: 27474218 DOI: 10.1093/brain/aww181] [Citation(s) in RCA: 19] [Impact Index Per Article: 3.2] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 11/13/2022] Open
Affiliation(s)
- Cyril Mignot
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Département de Génétique and Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares and GRC UPMC "Déficiences Intellectuelles et Autisme", Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Marie-Laure Moutard
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Service de Neuropédiatrie, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France
| | - Agnès Rastetter
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, and Inserm U 1127, and CNRS UMR 7225, and ICM, F-75013 Paris, France
| | - Lucile Boutaud
- INSERM U1163, Laboratory of Embryology and Genetics of Congenital Malformations, Paris Descartes University, Sorbonne Paris Cite and Imagine Institute, 75015 Paris, France.,Département de Génétique, Hôpital Necker - Enfants Malades, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, 75015 Paris, France
| | - Solveig Heide
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Département de Génétique and Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares and GRC UPMC "Déficiences Intellectuelles et Autisme", Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France.,Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, and Inserm U 1127, and CNRS UMR 7225, and ICM, F-75013 Paris, France
| | - Thierry Billette
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Service de Neuropédiatrie, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France
| | - Diane Doummar
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Service de Neuropédiatrie, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France
| | - Catherine Garel
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Service de Radiologie, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France
| | - Alexandra Afenjar
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Département de Génétique and Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares and GRC UPMC "Déficiences Intellectuelles et Autisme", Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Aurélia Jacquette
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Département de Génétique and Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares and GRC UPMC "Déficiences Intellectuelles et Autisme", Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Didier Lacombe
- CHU de Bordeaux, Service de Génétique Médicale, Centre de Référence Anomalies du développement et syndromes malformatifs, Bordeaux, France.,INSERM U1211, Université de Bordeaux, Bordeaux, France
| | - Alain Verloes
- Department of Genetics, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Robert Debré University Hospital, Paris, France
| | - Christine Bole-Feysot
- Plateforme Génomique, INSERM U1163, Université Paris Descartes-Sorbonne Paris Cité, Institut Imagine, Paris, France
| | - Patrick Nitschké
- Bioinformatic Platform, INSERM UMR 1163, Paris Descartes-Sorbonne Paris Cité University, Imagine Institute, Necker-Enfants Malades Hospital, Paris, France
| | - Cécile Masson
- Bioinformatic Platform, INSERM UMR 1163, Paris Descartes-Sorbonne Paris Cité University, Imagine Institute, Necker-Enfants Malades Hospital, Paris, France
| | - Anne Faudet
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Département de Génétique and Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares and GRC UPMC "Déficiences Intellectuelles et Autisme", Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Fabien Lesne
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Département de Génétique and Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares and GRC UPMC "Déficiences Intellectuelles et Autisme", Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - Thierry Bienvenu
- Inserm, U1016, Institut Cochin, Paris, France.,CNRS, UMR8104, Paris, France.,Université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Paris, France.,Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Groupe Universitaire Paris Centre, Site Cochin, Laboratoire de Biochimie et Génétique Moléculaire, Paris, France
| | - Caroline Alby
- INSERM U1163, Laboratory of Embryology and Genetics of Congenital Malformations, Paris Descartes University, Sorbonne Paris Cite and Imagine Institute, 75015 Paris, France.,Département de Génétique, Hôpital Necker - Enfants Malades, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, 75015 Paris, France
| | - Tania Attié-Bitach
- INSERM U1163, Laboratory of Embryology and Genetics of Congenital Malformations, Paris Descartes University, Sorbonne Paris Cite and Imagine Institute, 75015 Paris, France.,Département de Génétique, Hôpital Necker - Enfants Malades, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, 75015 Paris, France
| | - Christel Depienne
- Département de Médicine translationnelle et Neurogénétique, IGBMC, CNRS UMR 7104/INSERM U964/Université de Strasbourg, 67400 Illkirch, France.,Laboratoire de cytogénétique, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
| | - Caroline Nava
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Département de Génétique and Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares and GRC UPMC "Déficiences Intellectuelles et Autisme", Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France.,Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, and Inserm U 1127, and CNRS UMR 7225, and ICM, F-75013 Paris, France
| | - Delphine Héron
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Département de Génétique and Centre de Référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares and GRC UPMC "Déficiences Intellectuelles et Autisme", Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Paris, France
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7
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Heide S, Keren B, Billette de Villemeur T, Chantot-Bastaraud S, Depienne C, Nava C, Mignot C, Jacquette A, Fonteneau E, Lejeune E, Mach C, Marey I, Whalen S, Lacombe D, Naudion S, Rooryck C, Toutain A, Caignec CL, Haye D, Olivier-Faivre L, Masurel-Paulet A, Thauvin-Robinet C, Lesne F, Faudet A, Ville D, des Portes V, Sanlaville D, Siffroi JP, Moutard ML, Héron D. Copy Number Variations Found in Patients with a Corpus Callosum Abnormality and Intellectual Disability. J Pediatr 2017; 185:160-166.e1. [PMID: 28284480 DOI: 10.1016/j.jpeds.2017.02.023] [Citation(s) in RCA: 24] [Impact Index Per Article: 3.4] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [MESH Headings] [Track Full Text] [Journal Information] [Submit a Manuscript] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 09/29/2016] [Revised: 12/15/2016] [Accepted: 02/08/2017] [Indexed: 01/19/2023]
Abstract
OBJECTIVE To evaluate the role that chromosomal micro-rearrangements play in patients with both corpus callosum abnormality and intellectual disability, we analyzed copy number variations (CNVs) in patients with corpus callosum abnormality/intellectual disability STUDY DESIGN: We screened 149 patients with corpus callosum abnormality/intellectual disability using Illumina SNP arrays. RESULTS In 20 patients (13%), we have identified at least 1 CNV that likely contributes to corpus callosum abnormality/intellectual disability phenotype. We confirmed that the most common rearrangement in corpus callosum abnormality/intellectual disability is inverted duplication with terminal deletion of the 8p chromosome (3.2%). In addition to the identification of known recurrent CNVs, such as deletions 6qter, 18q21 (including TCF4), 1q43q44, 17p13.3, 14q12, 3q13, 3p26, and 3q26 (including SOX2), our analysis allowed us to refine the 2 known critical regions associated with 8q21.1 deletion and 19p13.1 duplication relevant for corpus callosum abnormality; report a novel 10p12 deletion including ZEB1 recently implicated in corpus callosum abnormality with corneal dystrophy; and) report a novel pathogenic 7q36 duplication encompassing SHH. In addition, 66 variants of unknown significance were identified in 57 patients encompassed candidate genes. CONCLUSIONS Our results confirm the relevance of using microarray analysis as first line test in patients with corpus callosum abnormality/intellectual disability.
Collapse
MESH Headings
- Adolescent
- Adult
- Agenesis of Corpus Callosum/genetics
- Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factors/genetics
- Cell Cycle Proteins/genetics
- Child
- Child, Preschool
- Chromosome Deletion
- Chromosome Duplication
- Chromosomes, Human, Pair 10
- Chromosomes, Human, Pair 19
- Chromosomes, Human, Pair 3
- Chromosomes, Human, Pair 7
- Chromosomes, Human, Pair 8
- DNA Copy Number Variations
- Female
- Hedgehog Proteins/genetics
- Humans
- Intellectual Disability/genetics
- Male
- Microarray Analysis
- Polymorphism, Single Nucleotide
- Prospective Studies
- Young Adult
- Zinc Finger E-box-Binding Homeobox 1/genetics
Collapse
Affiliation(s)
- Solveig Heide
- APHP, GH Pitié Salpêtrière, Department of genetics, unit of medical genetics, reference center for intellectual disabilities of rare causes, Paris, France; GRC Intellectual Disability and Autism, UPMC, Paris, France; Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, Inserm U 1127, CNRS UMR 7225, ICM, Paris, France.
| | - Boris Keren
- APHP, GH Pitié-Salpêtrière, Department of genetics, unit of developmental genomic, Paris, France
| | - Thierry Billette de Villemeur
- APHP, Hôpital Armand-Trousseau, Division of pediatric neurology, Paris, France; GRC ConCer-LD, UPMC, Paris, France; Inserm U1141, Paris, France
| | - Sandra Chantot-Bastaraud
- APHP, Hôpital Armand-Trousseau, Department of genetics, division of chromosomal genetics, Paris, France
| | - Christel Depienne
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, Inserm U 1127, CNRS UMR 7225, ICM, Paris, France; APHP, GH Pitié-Salpêtrière, Department of genetics, unit of developmental genomic, Paris, France; Department of translational medicine and neurogenetics, IGBMC, CNRS UMR 7104/INSERM U964, Université de Strasbourg, Illkirch, France; Institute of medical genetics of Alsace, Division of cytogenetics, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
| | - Caroline Nava
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, Inserm U 1127, CNRS UMR 7225, ICM, Paris, France; APHP, GH Pitié-Salpêtrière, Department of genetics, unit of developmental genomic, Paris, France
| | - Cyril Mignot
- APHP, GH Pitié Salpêtrière, Department of genetics, unit of medical genetics, reference center for intellectual disabilities of rare causes, Paris, France
| | - Aurélia Jacquette
- APHP, GH Pitié Salpêtrière, Department of genetics, unit of medical genetics, reference center for intellectual disabilities of rare causes, Paris, France
| | - Eric Fonteneau
- APHP, GH Pitié-Salpêtrière, Department of genetics, unit of developmental genomic, Paris, France
| | - Elodie Lejeune
- APHP, GH Pitié-Salpêtrière, Department of genetics, unit of developmental genomic, Paris, France
| | - Corinne Mach
- APHP, GH Pitié-Salpêtrière, Department of genetics, unit of developmental genomic, Paris, France
| | - Isabelle Marey
- APHP, GH Pitié Salpêtrière, Department of genetics, unit of medical genetics, reference center for intellectual disabilities of rare causes, Paris, France
| | - Sandra Whalen
- APHP, Hôpital Armand-Trousseau, Department of genetics, Division of clinical genetics, Paris, France
| | - Didier Lacombe
- CHU Bordeaux, Division of medical genetics, INSERM U1211, Université de Bordeaux, Bordeaux, France
| | - Sophie Naudion
- CHU Bordeaux, Division of medical genetics, INSERM U1211, Université de Bordeaux, Bordeaux, France
| | - Caroline Rooryck
- CHU Bordeaux, Division of medical genetics, INSERM U1211, Université de Bordeaux, Bordeaux, France
| | - Annick Toutain
- Hôpital Bretonneau, CHU Tours, Division of genetics, Tours, France
| | - Cédric Le Caignec
- CHU Nantes, Institute of biology, Division of medical genetics, Inserm UMR 915/CNRS ERL3147, Nantes, France
| | - Damien Haye
- APHP, Hôpital Robert-Debré, Division of medical genetics, Paris, France
| | | | | | | | - Fabien Lesne
- APHP, GH Pitié Salpêtrière, Department of genetics, unit of medical genetics, reference center for intellectual disabilities of rare causes, Paris, France
| | - Anne Faudet
- APHP, GH Pitié Salpêtrière, Department of genetics, unit of medical genetics, reference center for intellectual disabilities of rare causes, Paris, France
| | - Dorothée Ville
- HCL, GH Est, Division of pediatric neurology, Bron, France
| | | | - Damien Sanlaville
- HCL, Division of genetics, Bron, France; Center of Research in neurosciences of Lyon, Inserm U1028, UMR CNRS 5292, GENDEV Team, Université Claude BernardLyon 1, Lyon, France
| | - Jean-Pierre Siffroi
- APHP, Hôpital Armand-Trousseau, Department of genetics, division of chromosomal genetics, Paris, France
| | - Marie-Laure Moutard
- APHP, Hôpital Armand-Trousseau, Division of pediatric neurology, Paris, France; GRC ConCer-LD, UPMC, Paris, France; Inserm U1141, Paris, France
| | - Delphine Héron
- APHP, GH Pitié Salpêtrière, Department of genetics, unit of medical genetics, reference center for intellectual disabilities of rare causes, Paris, France; GRC Intellectual Disability and Autism, UPMC, Paris, France; Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, Inserm U 1127, CNRS UMR 7225, ICM, Paris, France; APHP, Hôpital Armand-Trousseau, Department of genetics, Division of clinical genetics, Paris, France
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8
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Marsh APL, Heron D, Edwards TJ, Quartier A, Galea C, Nava C, Rastetter A, Moutard ML, Anderson V, Bitoun P, Bunt J, Faudet A, Garel C, Gillies G, Gobius I, Guegan J, Heide S, Keren B, Lesne F, Lukic V, Mandelstam SA, McGillivray G, McIlroy A, Méneret A, Mignot C, Morcom LR, Odent S, Paolino A, Pope K, Riant F, Robinson GA, Spencer-Smith M, Srour M, Stephenson SEM, Tankard R, Trouillard O, Welniarz Q, Wood A, Brice A, Rouleau G, Attié-Bitach T, Delatycki MB, Mandel JL, Amor DJ, Roze E, Piton A, Bahlo M, Billette de Villemeur T, Sherr EH, Leventer RJ, Richards LJ, Lockhart PJ, Depienne C. Mutations in DCC cause isolated agenesis of the corpus callosum with incomplete penetrance. Nat Genet 2017; 49:511-514. [PMID: 28250454 DOI: 10.1038/ng.3794] [Citation(s) in RCA: 62] [Impact Index Per Article: 8.9] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 06/10/2016] [Accepted: 01/25/2017] [Indexed: 12/15/2022]
Abstract
Brain malformations involving the corpus callosum are common in children with developmental disabilities. We identified DCC mutations in four families and five sporadic individuals with isolated agenesis of the corpus callosum (ACC) without intellectual disability. DCC mutations result in variable dominant phenotypes with decreased penetrance, including mirror movements and ACC associated with a favorable developmental prognosis. Possible phenotypic modifiers include the type and location of mutation and the sex of the individual.
Collapse
Affiliation(s)
- Ashley P L Marsh
- Bruce Lefroy Centre for Genetic Health Research, Murdoch Childrens Research Institute, Royal Children's Hospital, Parkville, Victoria, Australia.,Department of Paediatrics, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia
| | - Delphine Heron
- AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, Paris, France.,Groupe de Recherche Clinique (GRC) `Déficience Intellectuelle et Autisme' UPMC, Paris, France.,Centre de Référence `Déficiences Intellectuelles de Causes Rares', Paris, France
| | - Timothy J Edwards
- Queensland Brain Institute, University of Queensland, St. Lucia, Brisbane, Australia.,School of Medicine, University of Queensland, Herston, Brisbane, Australia
| | - Angélique Quartier
- IGBMC, Université de Strasbourg, CNRS, INSERM, UMR7104 U964, Strasbourg, France
| | - Charles Galea
- Drug Delivery, Disposition and Dynamics (D4), Monash Institute of Pharmaceutical Sciences, Monash University, Parkville, Victoria, Australia
| | - Caroline Nava
- AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, Paris, France.,INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127, Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière (ICM), Paris, France
| | - Agnès Rastetter
- INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127, Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière (ICM), Paris, France
| | - Marie-Laure Moutard
- AP-HP, Hôpital Trousseau, Service de Neuropédiatrie, Paris, France.,UPMC, GRC ConCer-LD, Sorbonne Université, Paris, France.,Centre de Référence `Neurogénétique', Paris, France
| | - Vicki Anderson
- Developmental Imaging and Child Neuropsychology Research Groups, Murdoch Childrens Research Institute, Parkville, Victoria, Australia
| | - Pierre Bitoun
- Génétique Médicale, CHU Paris Nord, Hôpital Jean Verdier, Bondy, France
| | - Jens Bunt
- Queensland Brain Institute, University of Queensland, St. Lucia, Brisbane, Australia
| | - Anne Faudet
- AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, Paris, France
| | - Catherine Garel
- AP-HP GHUEP, Hôpital Armand Trousseau, Service de Radiologie, Paris, France
| | - Greta Gillies
- Bruce Lefroy Centre for Genetic Health Research, Murdoch Childrens Research Institute, Royal Children's Hospital, Parkville, Victoria, Australia
| | - Ilan Gobius
- Queensland Brain Institute, University of Queensland, St. Lucia, Brisbane, Australia
| | | | - Solveig Heide
- AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, Paris, France.,Groupe de Recherche Clinique (GRC) `Déficience Intellectuelle et Autisme' UPMC, Paris, France
| | - Boris Keren
- AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, Paris, France.,INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127, Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière (ICM), Paris, France
| | - Fabien Lesne
- AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, Paris, France
| | - Vesna Lukic
- Bioinformatics Division, Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research, Parkville, Victoria, Australia
| | - Simone A Mandelstam
- Department of Paediatrics, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia.,Florey Institute of Neuroscience and Mental Health, Melbourne, Victoria, Australia.,Department of Radiology, University of Melbourne, Royal Children's Hospital, Parkville, Victoria, Australia
| | - George McGillivray
- Victorian Clinical Genetics Services, Murdoch Childrens Research Institute, Parkville, Victoria, Australia
| | - Alissandra McIlroy
- Developmental Imaging and Child Neuropsychology Research Groups, Murdoch Childrens Research Institute, Parkville, Victoria, Australia
| | - Aurélie Méneret
- INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127, Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière (ICM), Paris, France.,AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Neurologie, Paris, France
| | - Cyril Mignot
- AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, Paris, France.,Groupe de Recherche Clinique (GRC) `Déficience Intellectuelle et Autisme' UPMC, Paris, France.,Centre de Référence `Déficiences Intellectuelles de Causes Rares', Paris, France
| | - Laura R Morcom
- Queensland Brain Institute, University of Queensland, St. Lucia, Brisbane, Australia
| | - Sylvie Odent
- Service de Génétique Clinique, Centre de Référence CLAD-Ouest, CHU Rennes, Rennes, France.,UMR 6290 CNRS, IGDR Institut de Génétique et Développement de Rennes, Université de Rennes 1, Rennes, France
| | - Annalisa Paolino
- Queensland Brain Institute, University of Queensland, St. Lucia, Brisbane, Australia
| | - Kate Pope
- Bruce Lefroy Centre for Genetic Health Research, Murdoch Childrens Research Institute, Royal Children's Hospital, Parkville, Victoria, Australia
| | - Florence Riant
- AP-HP, Groupe Hospitalier Saint-Louis -La Riboisière -Fernand Vidal, Laboratoire de Génétique, Paris, France
| | - Gail A Robinson
- Neuropsychology Research Unit, School of Psychology, University of Queensland, Brisbane, Australia
| | - Megan Spencer-Smith
- Developmental Imaging and Child Neuropsychology Research Groups, Murdoch Childrens Research Institute, Parkville, Victoria, Australia.,School of Psychological Sciences and Monash Institute of Cognitive and Clinical Neurosciences, Monash University, Clayton, Victoria, Australia
| | - Myriam Srour
- Department of Pediatrics, Montreal Children's Hospital, McGill University, Montreal, Quebec, Canada.,Department of Neurology and Neurosurgery, McGill University Health Center, Montreal, Quebec, Canada
| | - Sarah E M Stephenson
- Bruce Lefroy Centre for Genetic Health Research, Murdoch Childrens Research Institute, Royal Children's Hospital, Parkville, Victoria, Australia.,Department of Paediatrics, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia
| | - Rick Tankard
- Population Health and Immunity Division, Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research, Parkville, Victoria, Australia.,Department of Medical Biology, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia
| | - Oriane Trouillard
- INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127, Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière (ICM), Paris, France
| | - Quentin Welniarz
- INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127, Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière (ICM), Paris, France.,Institut de Biologie Paris Seine, Neuroscience Paris Seine, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, INSERM, CNRS, Paris, France
| | - Amanda Wood
- Developmental Imaging and Child Neuropsychology Research Groups, Murdoch Childrens Research Institute, Parkville, Victoria, Australia.,School of Life and Health Sciences, Aston University, Birmingham, UK
| | - Alexis Brice
- AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, Paris, France.,INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127, Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière (ICM), Paris, France
| | - Guy Rouleau
- Department of Neurology and Neurosurgery, McGill University Health Center, Montreal, Quebec, Canada.,Montreal Neurological Institute and Hospital, McGill University, Montréal, Quebec, Canada
| | - Tania Attié-Bitach
- INSERM U1163, Laboratory of Embryology and Genetics of Congenital Malformations, Paris-Descartes University, Sorbonne Paris Cité and Imagine Institute, Paris, France.,AP-HP, Hôpital Necker-Enfants Malades, Département de Génétique, Paris, France
| | - Martin B Delatycki
- Bruce Lefroy Centre for Genetic Health Research, Murdoch Childrens Research Institute, Royal Children's Hospital, Parkville, Victoria, Australia.,Department of Paediatrics, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia.,Victorian Clinical Genetics Services, Parkville, Victoria, Australia
| | - Jean-Louis Mandel
- IGBMC, Université de Strasbourg, CNRS, INSERM, UMR7104 U964, Strasbourg, France.,Laboratoires de Génétique, Institut de Génétique Médicale d'Alsace, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
| | - David J Amor
- Bruce Lefroy Centre for Genetic Health Research, Murdoch Childrens Research Institute, Royal Children's Hospital, Parkville, Victoria, Australia.,Department of Paediatrics, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia
| | - Emmanuel Roze
- INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127, Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière (ICM), Paris, France.,AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Neurologie, Paris, France
| | - Amélie Piton
- IGBMC, Université de Strasbourg, CNRS, INSERM, UMR7104 U964, Strasbourg, France.,Laboratoires de Génétique, Institut de Génétique Médicale d'Alsace, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
| | - Melanie Bahlo
- Population Health and Immunity Division, Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research, Parkville, Victoria, Australia.,Department of Medical Biology, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia
| | - Thierry Billette de Villemeur
- Centre de Référence `Déficiences Intellectuelles de Causes Rares', Paris, France.,AP-HP, Hôpital Trousseau, Service de Neuropédiatrie, Paris, France.,UPMC, GRC ConCer-LD, Sorbonne Université, Paris, France.,INSERM U1141, Paris, France
| | - Elliott H Sherr
- Department of Neurology, UCSF Benioff Children's Hospital, San Francisco, California, USA
| | - Richard J Leventer
- Department of Paediatrics, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia.,Neuroscience Research Group, Murdoch Childrens Research Institute, Parkville, Victoria, Australia.,Department of Neurology, University of Melbourne, Royal Children's Hospital, Parkville, Victoria, Australia
| | - Linda J Richards
- Queensland Brain Institute, University of Queensland, St. Lucia, Brisbane, Australia.,University of Queensland, School of Biomedical Sciences, St. Lucia, Brisbane, Australia
| | - Paul J Lockhart
- Bruce Lefroy Centre for Genetic Health Research, Murdoch Childrens Research Institute, Royal Children's Hospital, Parkville, Victoria, Australia.,Department of Paediatrics, University of Melbourne, Parkville, Victoria, Australia
| | - Christel Depienne
- AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, Paris, France.,IGBMC, Université de Strasbourg, CNRS, INSERM, UMR7104 U964, Strasbourg, France.,INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06 UMR S 1127, Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière (ICM), Paris, France.,Laboratoires de Génétique, Institut de Génétique Médicale d'Alsace, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France
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Nava C, Rupp J, Boissel JP, Mignot C, Rastetter A, Amiet C, Jacquette A, Dupuits C, Bouteiller D, Keren B, Ruberg M, Faudet A, Doummar D, Philippe A, Périsse D, Laurent C, Lebrun N, Guillemot V, Chelly J, Cohen D, Héron D, Brice A, Closs EI, Depienne C. Hypomorphic variants of cationic amino acid transporter 3 in males with autism spectrum disorders. Amino Acids 2015. [PMID: 26215737 PMCID: PMC4633447 DOI: 10.1007/s00726-015-2057-3] [Citation(s) in RCA: 8] [Impact Index Per Article: 0.9] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Download PDF] [Figures] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 12/27/2022]
Abstract
Cationic amino acid transporters (CATs) mediate the entry of L-type cationic amino acids (arginine, ornithine and lysine) into the cells including neurons. CAT-3, encoded by the SLC7A3 gene on chromosome X, is one of the three CATs present in the human genome, with selective expression in brain. SLC7A3 is highly intolerant to variation in humans, as attested by the low frequency of deleterious variants in available databases, but the impact on variants in this gene in humans remains undefined. In this study, we identified a missense variant in SLC7A3, encoding the CAT-3 cationic amino acid transporter, on chromosome X by exome sequencing in two brothers with autism spectrum disorder (ASD). We then sequenced the SLC7A3 coding sequence in 148 male patients with ASD and identified three additional rare missense variants in unrelated patients. Functional analyses of the mutant transporters showed that two of the four identified variants cause severe or moderate loss of CAT-3 function due to altered protein stability or abnormal trafficking to the plasma membrane. The patient with the most deleterious SLC7A3 variant had high-functioning autism and epilepsy, and also carries a de novo 16p11.2 duplication possibly contributing to his phenotype. This study shows that rare hypomorphic variants of SLC7A3 exist in male individuals and suggest that SLC7A3 variants possibly contribute to the etiology of ASD in male subjects in association with other genetic factors.
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Affiliation(s)
- Caroline Nava
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, ICM, 75013, Paris, France.,INSERM, U 1127, 75013, Paris, France.,CNRS, UMR 7225, 75013, Paris, France.,Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), 75013, Paris, France.,Département de Génétique et de Cytogénétique, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France
| | - Johanna Rupp
- Department of Pharmacology, University Medical Center of the Johannes Gutenberg University, Mainz, Germany
| | - Jean-Paul Boissel
- Department of Pharmacology, University Medical Center of the Johannes Gutenberg University, Mainz, Germany
| | - Cyril Mignot
- Département de Génétique et de Cytogénétique, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France.,Centre de Référence "déficiences intellectuelles de causes rares", Paris, France.,Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme" UPMC, Paris, France.,Service de neuropédiatrie, Hôpital Trousseau, AP-HP, Paris, France
| | - Agnès Rastetter
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, ICM, 75013, Paris, France.,INSERM, U 1127, 75013, Paris, France.,CNRS, UMR 7225, 75013, Paris, France.,Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), 75013, Paris, France
| | - Claire Amiet
- Service de psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, Hôpital Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France
| | - Aurélia Jacquette
- Département de Génétique et de Cytogénétique, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France.,Centre de Référence "déficiences intellectuelles de causes rares", Paris, France.,Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme" UPMC, Paris, France
| | - Céline Dupuits
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, ICM, 75013, Paris, France.,INSERM, U 1127, 75013, Paris, France.,CNRS, UMR 7225, 75013, Paris, France.,Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), 75013, Paris, France
| | - Delphine Bouteiller
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, ICM, 75013, Paris, France.,INSERM, U 1127, 75013, Paris, France.,CNRS, UMR 7225, 75013, Paris, France.,Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), 75013, Paris, France
| | - Boris Keren
- Département de Génétique et de Cytogénétique, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France
| | - Merle Ruberg
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, ICM, 75013, Paris, France.,INSERM, U 1127, 75013, Paris, France.,CNRS, UMR 7225, 75013, Paris, France.,Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), 75013, Paris, France
| | - Anne Faudet
- Département de Génétique et de Cytogénétique, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France
| | - Diane Doummar
- Service de neuropédiatrie, Hôpital Trousseau, AP-HP, Paris, France
| | - Anne Philippe
- Service de psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, Hôpital Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France
| | - Didier Périsse
- Service de psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, Hôpital Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France.,Centre Diagnostic Autisme de l'Hôpital Pitié-Salpêtrière, 75013, Paris, France
| | - Claudine Laurent
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, ICM, 75013, Paris, France.,INSERM, U 1127, 75013, Paris, France.,CNRS, UMR 7225, 75013, Paris, France.,Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), 75013, Paris, France.,Service de psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, Hôpital Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France
| | - Nicolas Lebrun
- Institut Cochin, Inserm U567, UMR 8104, Université René Descartes, Paris 5, France
| | - Vincent Guillemot
- Bioinformatics and Biostatistics Core Facility (iCONICS), Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), Paris, France
| | - Jamel Chelly
- Institut Cochin, Inserm U567, UMR 8104, Université René Descartes, Paris 5, France
| | - David Cohen
- Service de psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, Hôpital Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France.,Institut des Systèmes Intelligents et Robotiques, CNRS UMR 7222, UPMC-Paris-6, Paris, France
| | - Delphine Héron
- Département de Génétique et de Cytogénétique, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France.,Centre de Référence "déficiences intellectuelles de causes rares", Paris, France.,Groupe de Recherche Clinique (GRC) "déficience intellectuelle et autisme" UPMC, Paris, France.,Service de neuropédiatrie, Hôpital Trousseau, AP-HP, Paris, France
| | - Alexis Brice
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, ICM, 75013, Paris, France.,INSERM, U 1127, 75013, Paris, France.,CNRS, UMR 7225, 75013, Paris, France.,Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), 75013, Paris, France.,Département de Génétique et de Cytogénétique, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France
| | - Ellen I Closs
- Department of Pharmacology, University Medical Center of the Johannes Gutenberg University, Mainz, Germany
| | - Christel Depienne
- Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, ICM, 75013, Paris, France. .,INSERM, U 1127, 75013, Paris, France. .,CNRS, UMR 7225, 75013, Paris, France. .,Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), 75013, Paris, France. .,Département de Génétique et de Cytogénétique, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, AP-HP, 75013, Paris, France.
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Ramos-Brossier M, Montani C, Lebrun N, Gritti L, Martin C, Seminatore-Nole C, Toussaint A, Moreno S, Poirier K, Dorseuil O, Chelly J, Hackett A, Gecz J, Bieth E, Faudet A, Heron D, Frank Kooy R, Loeys B, Humeau Y, Sala C, Billuart P. Novel IL1RAPL1 mutations associated with intellectual disability impair synaptogenesis. Hum Mol Genet 2014; 24:1106-18. [PMID: 25305082 DOI: 10.1093/hmg/ddu523] [Citation(s) in RCA: 23] [Impact Index Per Article: 2.3] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 01/02/2023] Open
Abstract
Mutations in interleukin-1 receptor accessory protein like 1 (IL1RAPL1) gene have been associated with non-syndromic intellectual disability (ID) and autism spectrum disorder. This protein interacts with synaptic partners like PSD-95 and PTPδ, regulating the formation and function of excitatory synapses. The aim of this work was to characterize the synaptic consequences of three IL1RAPL1 mutations, two novel causing the deletion of exon 6 (Δex6) and one point mutation (C31R), identified in patients with ID. Using immunofluorescence and electrophysiological recordings, we examined the effects of IL1RAPL1 mutant over-expression on synapse formation and function in cultured rodent hippocampal neurons. Δex6 but not C31R mutation leads to IL1RAPL1 protein instability and mislocalization within dendrites. Analysis of different markers of excitatory synapses and sEPSC recording revealed that both mutants fail to induce pre- and post-synaptic differentiation, contrary to WT IL1RAPL1 protein. Cell aggregation and immunoprecipitation assays in HEK293 cells showed a reduction of the interaction between IL1RAPL1 mutants and PTPδ that could explain the observed synaptogenic defect in neurons. However, these mutants do not affect all cellular signaling because their over-expression still activates JNK pathway. We conclude that both mutations described in this study lead to a partial loss of function of the IL1RAPL1 protein through different mechanisms. Our work highlights the important function of the trans-synaptic PTPδ/IL1RAPL1 interaction in synaptogenesis and as such in ID in the patients.
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Affiliation(s)
- Mariana Ramos-Brossier
- Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Descartes, Paris 75014, France
| | - Caterina Montani
- CNR Neuroscience Institute and Department of Medical Biotechnology and Translational Medicine, University of Milan, Milan 20129, Italy
| | - Nicolas Lebrun
- Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Descartes, Paris 75014, France
| | - Laura Gritti
- CNR Neuroscience Institute and Department of Medical Biotechnology and Translational Medicine, University of Milan, Milan 20129, Italy
| | | | | | - Aurelie Toussaint
- Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Laboratoire de Biochimie et Génétique Moléculaire, Hôpital Cochin, APHP, Paris 75014, France
| | - Sarah Moreno
- Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Descartes, Paris 75014, France
| | - Karine Poirier
- Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Descartes, Paris 75014, France
| | - Olivier Dorseuil
- Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Descartes, Paris 75014, France
| | - Jamel Chelly
- Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Descartes, Paris 75014, France
| | - Anna Hackett
- Genetics of Learning Disability Service, Hunter Genetics, Waratah, NSW 2298, Australia
| | - Jozef Gecz
- School of Paediatrics and Reproductive Health, Robinson Institute, The University of Adelaide, Adelaide, SA 5006, Australia
| | - Eric Bieth
- Service de Génétique Médicale, Hôpital Purpan, Toulouse 31059, France
| | - Anne Faudet
- Genetics and Cytogenetics Department, GRC-UPMC, Pitié-Salpetrière CHU, Paris 75013, France and
| | - Delphine Heron
- Genetics and Cytogenetics Department, GRC-UPMC, Pitié-Salpetrière CHU, Paris 75013, France and
| | - R Frank Kooy
- Department of Medical Genetics, Faculty of Medicine and Health Sciences, University and University Hospital Antwerp, Antwerp 2610, Belgium
| | - Bart Loeys
- Department of Medical Genetics, Faculty of Medicine and Health Sciences, University and University Hospital Antwerp, Antwerp 2610, Belgium
| | - Yann Humeau
- IINS, CNRS UMR5297, Université de Bordeaux, Bordeaux 33000, France
| | - Carlo Sala
- CNR Neuroscience Institute and Department of Medical Biotechnology and Translational Medicine, University of Milan, Milan 20129, Italy
| | - Pierre Billuart
- Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Descartes, Paris 75014, France,
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Nava C, Keren B, Mignot C, Rastetter A, Chantot-Bastaraud S, Faudet A, Fonteneau E, Amiet C, Laurent C, Jacquette A, Whalen S, Afenjar A, Périsse D, Doummar D, Dorison N, Leboyer M, Siffroi JP, Cohen D, Brice A, Héron D, Depienne C. Prospective diagnostic analysis of copy number variants using SNP microarrays in individuals with autism spectrum disorders. Eur J Hum Genet 2013; 22:71-8. [PMID: 23632794 DOI: 10.1038/ejhg.2013.88] [Citation(s) in RCA: 54] [Impact Index Per Article: 4.9] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 12/11/2012] [Revised: 02/23/2013] [Accepted: 03/28/2013] [Indexed: 01/24/2023] Open
Abstract
Copy number variants (CNVs) have repeatedly been found to cause or predispose to autism spectrum disorders (ASDs). For diagnostic purposes, we screened 194 individuals with ASDs for CNVs using Illumina SNP arrays. In several probands, we also analyzed candidate genes located in inherited deletions to unmask autosomal recessive variants. Three CNVs, a de novo triplication of chromosome 15q11-q12 of paternal origin, a deletion on chromosome 9p24 and a de novo 3q29 deletion, were identified as the cause of the disorder in one individual each. An autosomal recessive cause was considered possible in two patients: a homozygous 1p31.1 deletion encompassing PTGER3 and a deletion of the entire DOCK10 gene associated with a rare hemizygous missense variant. We also identified multiple private or recurrent CNVs, the majority of which were inherited from asymptomatic parents. Although highly penetrant CNVs or variants inherited in an autosomal recessive manner were detected in rare cases, our results mainly support the hypothesis that most CNVs contribute to ASDs in association with other CNVs or point variants located elsewhere in the genome. Identification of these genetic interactions in individuals with ASDs constitutes a formidable challenge.
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Affiliation(s)
- Caroline Nava
- 1] INSERM, U975 (CRICM), Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [2] CNRS 7225 (CRICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [3] Université Pierre et Marie Curie-Paris-6 (UPMC), UMR_S 975, Paris, France [4] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique clinique, Paris, France
| | - Boris Keren
- AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de cytogénétique, Paris, France
| | - Cyril Mignot
- 1] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique clinique, Paris, France [2] AP-HP, Hôpital Armand Trousseau, Service de Neuropédiatrie, Paris, France [3] Centre de Référence 'déficiences intellectuelles de causes rares', Paris, France [4] Groupe de Recherche Clinique (GRC) 'déficience intellectuelle et autisme' UPMC, Paris, France
| | - Agnès Rastetter
- 1] INSERM, U975 (CRICM), Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [2] CNRS 7225 (CRICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [3] Université Pierre et Marie Curie-Paris-6 (UPMC), UMR_S 975, Paris, France
| | | | - Anne Faudet
- AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique clinique, Paris, France
| | - Eric Fonteneau
- AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de cytogénétique, Paris, France
| | - Claire Amiet
- AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Service de Psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, Paris, France
| | - Claudine Laurent
- 1] INSERM, U975 (CRICM), Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [2] CNRS 7225 (CRICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [3] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Service de Psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, Paris, France
| | - Aurélia Jacquette
- 1] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique clinique, Paris, France [2] Centre de Référence 'déficiences intellectuelles de causes rares', Paris, France [3] Groupe de Recherche Clinique (GRC) 'déficience intellectuelle et autisme' UPMC, Paris, France
| | - Sandra Whalen
- AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique clinique, Paris, France
| | - Alexandra Afenjar
- 1] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique clinique, Paris, France [2] AP-HP, Hôpital Armand Trousseau, Service de Neuropédiatrie, Paris, France [3] Centre de Référence 'déficiences intellectuelles de causes rares', Paris, France [4] Groupe de Recherche Clinique (GRC) 'déficience intellectuelle et autisme' UPMC, Paris, France [5] Centre de Référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France
| | - Didier Périsse
- 1] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Service de Psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, Paris, France [2] Centre Diagnostic Autisme, Pitié-Salpêtrière Hôpital, Paris, France
| | - Diane Doummar
- AP-HP, Hôpital Armand Trousseau, Service de Neuropédiatrie, Paris, France
| | - Nathalie Dorison
- 1] AP-HP, Hôpital Armand Trousseau, Service de Neuropédiatrie, Paris, France [2] Centre de Référence des anomalies du développement et syndromes malformatifs, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France
| | - Marion Leboyer
- 1] INSERM, U955, Créteil, France [2] Université Paris Est, Faculté de médecine, Créteil, France [3] AP-HP, Hôpital H Mondor - A. Chenevier, Pole de Psychiatrie, Créteil, France [4] Fondation FondaMental, Créteil, France
| | - Jean-Pierre Siffroi
- AP-HP, Hôpital Armand Trousseau, Service de Génétique et Embryologie Médicales, Paris, France
| | - David Cohen
- 1] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Service de Psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, Paris, France [2] Institut des Systèmes Intelligents et Robotiques, CNRS UMR 7222, UPMC-Paris-6, Paris, France
| | - Alexis Brice
- 1] INSERM, U975 (CRICM), Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [2] CNRS 7225 (CRICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [3] Université Pierre et Marie Curie-Paris-6 (UPMC), UMR_S 975, Paris, France [4] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique clinique, Paris, France [5] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de neurogénétique moléculaire et cellulaire, Paris, France
| | - Delphine Héron
- 1] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique clinique, Paris, France [2] AP-HP, Hôpital Armand Trousseau, Service de Neuropédiatrie, Paris, France [3] Centre de Référence 'déficiences intellectuelles de causes rares', Paris, France [4] Groupe de Recherche Clinique (GRC) 'déficience intellectuelle et autisme' UPMC, Paris, France
| | - Christel Depienne
- 1] INSERM, U975 (CRICM), Institut du cerveau et de la moelle épinière (ICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [2] CNRS 7225 (CRICM), Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris, France [3] Université Pierre et Marie Curie-Paris-6 (UPMC), UMR_S 975, Paris, France [4] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique clinique, Paris, France [5] AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de neurogénétique moléculaire et cellulaire, Paris, France
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Nava C, Lamari F, Héron D, Mignot C, Rastetter A, Keren B, Cohen D, Faudet A, Bouteiller D, Gilleron M, Jacquette A, Whalen S, Afenjar A, Périsse D, Laurent C, Dupuits C, Gautier C, Gérard M, Huguet G, Caillet S, Leheup B, Leboyer M, Gillberg C, Delorme R, Bourgeron T, Brice A, Depienne C. Analysis of the chromosome X exome in patients with autism spectrum disorders identified novel candidate genes, including TMLHE. Transl Psychiatry 2012; 2:e179. [PMID: 23092983 PMCID: PMC3565810 DOI: 10.1038/tp.2012.102] [Citation(s) in RCA: 73] [Impact Index Per Article: 6.1] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [Key Words] [Track Full Text] [Download PDF] [Figures] [Journal Information] [Submit a Manuscript] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 12/23/2022] Open
Abstract
The striking excess of affected males in autism spectrum disorders (ASD) suggests that genes located on chromosome X contribute to the etiology of these disorders. To identify new X-linked genes associated with ASD, we analyzed the entire chromosome X exome by next-generation sequencing in 12 unrelated families with two affected males. Thirty-six possibly deleterious variants in 33 candidate genes were found, including PHF8 and HUWE1, previously implicated in intellectual disability (ID). A nonsense mutation in TMLHE, which encodes the ɛ-N-trimethyllysine hydroxylase catalyzing the first step of carnitine biosynthesis, was identified in two brothers with autism and ID. By screening the TMLHE coding sequence in 501 male patients with ASD, we identified two additional missense substitutions not found in controls and not reported in databases. Functional analyses confirmed that the mutations were associated with a loss-of-function and led to an increase in trimethyllysine, the precursor of carnitine biosynthesis, in the plasma of patients. This study supports the hypothesis that rare variants on the X chromosome are involved in the etiology of ASD and contribute to the sex-ratio disequilibrium.
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Affiliation(s)
- C Nava
- INSERM, U975—CRICM, Institut du cerveau
et de la moelle épinière (ICM), Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,CNRS 7225—CRICM, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,Université Pierre et Marie
Curie-Paris-6 (UPMC), UMR_S 975, Paris, France,Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique
clinique, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France
| | - F Lamari
- Département de Biochimie, AP-HP,
Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris,
France
| | - D Héron
- Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique
clinique, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France,AP-HP, Hôpital Trousseau, service de
neuropédiatrie, Paris, France,Centre de Référence
‘déficiences intellectuelles de causes rares',
Paris, France,Groupe de Recherche Clinique (GRC)
‘déficience intellectuelle et autisme' UPMC,
Paris, France
| | - C Mignot
- Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique
clinique, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France,AP-HP, Hôpital Trousseau, service de
neuropédiatrie, Paris, France,Centre de Référence
‘déficiences intellectuelles de causes rares',
Paris, France,Groupe de Recherche Clinique (GRC)
‘déficience intellectuelle et autisme' UPMC,
Paris, France
| | - A Rastetter
- INSERM, U975—CRICM, Institut du cerveau
et de la moelle épinière (ICM), Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,CNRS 7225—CRICM, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,Université Pierre et Marie
Curie-Paris-6 (UPMC), UMR_S 975, Paris, France
| | - B Keren
- Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de
cytogénétique, AP-HP, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - D Cohen
- Service de psychiatrie de l'enfant et
de l'adolescent, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France,Institut des Systèmes Intelligents
et Robotiques, CNRS UMR 7222, UPMC-Paris-6, Paris,
France
| | - A Faudet
- Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique
clinique, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France
| | - D Bouteiller
- INSERM, U975—CRICM, Institut du cerveau
et de la moelle épinière (ICM), Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,CNRS 7225—CRICM, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,Université Pierre et Marie
Curie-Paris-6 (UPMC), UMR_S 975, Paris, France,ICM, PFGS Platform, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - M Gilleron
- Département de Biochimie, AP-HP,
Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris,
France
| | - A Jacquette
- Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique
clinique, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France,Centre de Référence
‘déficiences intellectuelles de causes rares',
Paris, France,Groupe de Recherche Clinique (GRC)
‘déficience intellectuelle et autisme' UPMC,
Paris, France
| | - S Whalen
- Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique
clinique, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France
| | - A Afenjar
- Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique
clinique, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France,AP-HP, Hôpital Trousseau, service de
neuropédiatrie, Paris, France,Centre de Référence
‘déficiences intellectuelles de causes rares',
Paris, France,Groupe de Recherche Clinique (GRC)
‘déficience intellectuelle et autisme' UPMC,
Paris, France,Centre de référence des
anomalies du développement et syndromes malformatifs, Hôpital
Trousseau, Paris, France
| | - D Périsse
- Service de psychiatrie de l'enfant et
de l'adolescent, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France,Centre référent
autisme, Paris, France
| | - C Laurent
- INSERM, U975—CRICM, Institut du cerveau
et de la moelle épinière (ICM), Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,CNRS 7225—CRICM, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,Service de psychiatrie de l'enfant et
de l'adolescent, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France
| | - C Dupuits
- INSERM, U975—CRICM, Institut du cerveau
et de la moelle épinière (ICM), Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,Service de diététique et
unité fonctionnelle de neurormétabolisme, AP-HP, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - C Gautier
- INSERM, U975—CRICM, Institut du cerveau
et de la moelle épinière (ICM), Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,CNRS 7225—CRICM, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - M Gérard
- CHU Côte de Nacre,
Paris, France
| | - G Huguet
- Institut Pasteur, Human Genetics and
Cognitive Functions Unit, Paris, France,CNRS URA 2182 ‘Genes, synapses and
cognition', Institut Pasteur, Paris, France,University Paris Diderot, Sorbonne Paris
Cité, Human Genetics and Cognitive Functions, Paris,
France
| | - S Caillet
- Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique
clinique, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France,Service de diététique et
unité fonctionnelle de neurormétabolisme, AP-HP, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France
| | - B Leheup
- CHU de Nancy Pôle Enfants, Service de
Médecine Infantile III et Génétique Clinique, Centre de
référence Anomalies du développement et Syndromes malformatifs et
Université de Lorraine EA 4368, Vandoeuvre les Nancy,
France
| | - M Leboyer
- Inserm, U955,
Créteil, France,Université Paris Est, Faculté
de médecine, Créteil, France,AP-HP, Hôpital H. Mondor—A.
Chenevier, Pole de Psychiatrie, Créteil, France,Fondation FondaMental,
Créteil, France
| | - C Gillberg
- Department of Child and Adolescent
Psychiatry, Goteborg University, Goteborg, Sweden
| | - R Delorme
- AP-HP, Hôpital Robert Debré,
Service de pédopsychiatrie, Paris, France
| | - T Bourgeron
- Institut Pasteur, Human Genetics and
Cognitive Functions Unit, Paris, France,CNRS URA 2182 ‘Genes, synapses and
cognition', Institut Pasteur, Paris, France,University Paris Diderot, Sorbonne Paris
Cité, Human Genetics and Cognitive Functions, Paris,
France
| | - A Brice
- INSERM, U975—CRICM, Institut du cerveau
et de la moelle épinière (ICM), Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,CNRS 7225—CRICM, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,Université Pierre et Marie
Curie-Paris-6 (UPMC), UMR_S 975, Paris, France,Département de Génétique
et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de génétique
clinique, AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris, France,INSERM U975 (Cricm), Institut du cerveau et de la moelle
épinière, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris
75 013, France. E-mail: or
| | - C Depienne
- INSERM, U975—CRICM, Institut du cerveau
et de la moelle épinière (ICM), Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,CNRS 7225—CRICM, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,Université Pierre et Marie
Curie-Paris-6 (UPMC), UMR_S 975, Paris, France,Département de
Génétique et de Cytogénétique, Unité fonctionnelle de
neurogénétique moléculaire et cellulaire, AP-HP, Hôpital
Pitié-Salpêtrière, Paris, France,INSERM U975 (Cricm), Institut du cerveau et de la moelle
épinière, Hôpital Pitié-Salpêtrière,
Paris
75 013, France. E-mail: or
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Verloes A, Héron D, Billette de Villemeur T, Afenjar A, Baumann C, Bahi-Buisson N, Charles P, Faudet A, Jacquette A, Mignot C, Moutard ML, Passemard S, Rio M, Robel L, Rougeot C, Ville D, Burglen L, des Portes V. Stratégie d’exploration d’une déficience intellectuelle inexpliquée. Arch Pediatr 2012; 19:194-207. [DOI: 10.1016/j.arcped.2011.11.014] [Citation(s) in RCA: 8] [Impact Index Per Article: 0.7] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Track Full Text] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Received: 09/23/2011] [Revised: 11/22/2011] [Accepted: 11/25/2011] [Indexed: 02/07/2023]
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Lacomblez L, Dib M, Doppler V, Faudet A, Robin V, Salachas F, Bensimon G, Meininger V. [Tolerance of riluzole in a phase IIIb clinical trial]. Therapie 2002; 57:65-71. [PMID: 12090150] [Citation(s) in RCA: 0] [Impact Index Per Article: 0] [Reference Citation Analysis] [What about the content of this article? (0)] [Affiliation(s)] [Abstract] [MESH Headings] [Journal Information] [Subscribe] [Scholar Register] [Indexed: 02/25/2023]
Abstract
Within the framework of an early drug access programme launched in 1995, a multicentre open study was initiated in France in order to assess, inter alia, the safety of riluzole (50 mg twice a day) in a total of 2069 patients from 28 centres. This programme, a phase IIIb study with direct individual benefit, had two main objectives: to enable patients to receive riluzole therapy pending regulatory approval and commercial availability and to provide further data on the safety of riluzole in a broader ALS population. The most frequent adverse events related to riluzole treatment were: asthenia, nausea and elevation of serum transaminase levels. These observations, similar to data derived from previous pivotal clinical trials, confirm that riluzole has a satisfactory tolerability profile.
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Affiliation(s)
- L Lacomblez
- AP-HP, Fédération de Neurologie Mazarin, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Paris
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